Hanna, Clara'yı Kuzey Romanya'nın engin ormanlarında saklar, diğer stajyerler ise Meadows adlı bir eğitim tesisine nakledilirler ve orada yeni kimlikler alırlar. Marissa, internette Clara'nın annesi gibi davranarak onu bulmaya çalışır ve Clara'yı Bükreş'teki bir otele çeker. Clara burada Utrax tarafından pusuya düşürülür ve yakalanır. Hanna, Marissa'yı takip eder ve onunla tekrar bir araya gelir.

Marissa ve Hanna, Paris'e dönerler, Clara ise Meadows'taki ortama dahil edilir. Ancak isyankar kişiliği yüzünden sorunlar çıkar ve Terri'ye onu tekrar programa katılması için ikna etme görevi verilir. Clara'nın izini süren Hanna, Utrax'in tıbbi implantlarını üreten eczacılık şirketini öğrenir ve bir ilaç deneyine katılır. Bu sayede ilaçların Meadows'taki stajyerlere gönderileceğini keşfeder.

Passway'e dönen Hanna, ilaçları şehirden çıkartan Dumont'u takip eder. Böylece Meadows'a ulaşacağını bilmektedir. Marissa, Sonia'nın Belçika'da olduğunu keşfedip Hanna'ya tam vaktinde ulaşır ve Sonia'yı öldürür. Hanna, Clara'yı kurtarmaya hazır bir hâlde Meadows'a ulaşır ancak Terri'nin Clara'ya ulaşma planının işe yaradığını ve Clara'nın Meadows'a uyum sağlamış göründüğünü keşfedince şoke olur.

Marissa, Meadows'ta Hanna'ya katılır ve kaçış planı hazırlayarak Hanna'nın kendi tarafında olduğundan emin olur. Hanna onlara katılması için Clara'yı ikna eder ancak Meadows'taki ailevi topluluk Clara için çok rahat bir ortama dönüştüğünden Hanna'ya ihanet eder ve dizginleri tekrardan Carmichael'a kaptırır. CIA görevlisi Mannion, Meadows'u bulur ancak Hanna ya da Marissa'dan hiçbir iz yoktur...

Marissa, Meadows'ta tutsaktır, bu arada Hanna yeni kimliği Mia Wolff'u benimsemesi için teşvik edilmektedir. Ancak bunu yapabilmesi, Erik için yas tutmasına bağlıdır ve Terri bunu hızlandırmaya çalışır. Marissa kaçar ve oradan ayrılmak üzere Hanna'yı ikna eder ancak Clara onlara engel olur.

Hanna ve Jules ilk görevlerine gönderilir, amaçları Utrax'in sırlarını açığa çıkarmak isteyen bir ordu avukatıyla buluşmayı planlayan bir gazeteciyi Londra'da öldürmektir.

Hanna, Barselona'ya gelir ve Gelder'ı kurtarmaya, Clara'yı Utrax'i bırakmaya ikna etmeye çalışır. Hanna, Clara'ya annesinin adını ve yerini söyler ve Clara'nın kafası karışır. Sandy, Gelder'ın kızı Kat'in güvenini kazanır ve Clara onları öldürme planından cayınca küplere biner. Sandy, Gelder'ı öldürür, Hanna ve Clara ise Kat ile kaçar.

Carmichael, Gelder cinayetinden sonra Barselona'ya gelir. Hanna, Clara ve Kat tepedeki bir villada saklanır. Hanna otele dönüp Gelder'ın hedef listesini ele geçirir. Carmichael'ı villaya kadar takip eden Marissa, Utrax liderlerinin adalet karşısına çıkması için ona şantaj yapar. Hanna, Clara'nın annesine kavuşmasına izin verir ve Utrax'in yok edilmesine yardımcı olmak üzere Marissa'ya döner.