La Squadra Quinx è una sezione speciale di investigatori di ghoul, formata da umani ai quali è stata impiantata una kagune all’interno del corpo e perciò in possesso di molte delle abilità fisiche proprie dei ghoul.

Durante la lotta con Orochi, Sasaki scopre che sotto la sua maschera si nasconde Nishio. Sebbene abbia perso la memoria, dal profondo dei suoi ricordi riaffiora il nome del suo vecchio amico.

Alla vigilia di un’importante operazione congiunta con la Squadra Suzuya, i Quinx si trovano a dover fare a meno di Urie, ancora in convalescenza dopo essersi sottoposto alla procedura per l’aumento del frame.

Tooru e Suzuya vengono rapite da Nutcracker e vengono messe all'asta in uno speciale evento riservato ai ghoul.

La Squadra Quinx si precipita a salvare Mutsuki da Kanae. Urie è frustrato quando gli viene assegnato il semplice compito di fare la scorta.

Durante la lotta con Takizawa, Sasaki ha molte allucinazioni con Kaneki. Nel frattempo Nutcracker viene uccisa da Shirazu e Yonebayashi.

Sasaki chiede di esercitare il proprio diritto di possesso su Hinami per tenerla in vita. Akira Mado compila un rapporto sulle operazioni condotte durante la notte dell’asta.

Le condizioni di Tsukiyama peggiorano, Tatara e Ayato discutono sul salvataggio di Hinami. Inoltre Shirazu cerca di trovare il modo per impossessarsi del Quinque di Nutcracker.

Sasaki conduce i Quinx nel negozio di Uta affinché quest’ultimo possa creare per loro delle maschere da ghoul.

Eto cattura Kanae e la sottopone a torture fisiche e psicologiche affinché divenga una marionetta nelle sue mani. Haise continua la propria indagine personale sulle tracce di Amon e di Ken Kaneki.

Le Squadre della CCG si fanno strada all’interno del grattacielo sterminando i ghoul fedeli agli Tsukiyama. Ma anche tra gli investigatori le perdite sono ingenti.

Eto irrompe sul tetto del Luna Eclipse Building impedendo a Sasaki di dare il colpo di grazia a Shu e Kanae.

La CCG individua il quartier generale dell’Aogiri Tree. L'editore di Takatsuki è interrogato sul fatto che sia o meno una ghoul. Prima che Takatsuki possa essere interrogata, la ragazza decide di fare uno straordinario annuncio pubblico.

Ayato conduce un’incursione su Cochlea per salvare Hinami, viene quindi raggiunto da Touka e Yomo. Haise cerca di mettere in salvo Hinami, ma viene affrontato da Furuta.

L'aggressione della CCG nei confronti dell’Aogiri sull'isola di Rushima continua, Urie e Saiko sono ansiosi di salvare Mutsuki. Tatara e Kurona prendono posizione contro gli investigatori, mentre Akira riceve aiuto da qualcuno di inaspettato.

Mentre i combattimenti raggiungono l'apice, Akira prende una decisione fatale. Urie, insieme ai nuovi membri della Squadra Quinx, continua la sua ricerca di Mutsuki. Arima fa una rivelazione sorprendente a Kaneki.

Kaneki riunisce i restanti membri dell’Aogiri Tree e dell’Anteiku per annunciare la creazione di una nuova organizzazione di ghoul. Nel frattempo Yomo e Touka cercano entrambi di fare pace con il loro passato.

Gli investigatori della CCG che erano vicini ad Haise reagiscono alla sua partenza. Furuta assume la carica di capo della CCG e stabilisce una nuova strategia per affrontare i demoni.

Sotto Furuta, la CCG mostra il pugno di ferro contro la comunità dei ghoul, costringendo il Goat a nascondersi sottoterra. Takeomi e Yoriko hanno fissato un appuntamento per il matrimonio, mentre Mutsuki individua Kaneki, invitandolo a tornare.

Mutsuki guida gli Oggais in un'incursione nella tana sotterranea del Goat. Urie e Kuroiwa affrontano Furuta nel suo ufficio riguardo la sua idoneità a guidare la squadra. Per Kaneki e Suzuya è giunto il momento di affrontarsi in combattimento.

Mentre il dottor Kanou visita la tomba della sua famiglia, Kurona decide di affrontarlo. La CCG ottiene un nuovo alleato esperto di ghoul. Hide chiede l'aiuto di Akira e Amon per presentare la sua causa alla CCG.

Mentre il corpo di Kaneki giace dormiente nella sua gigantesca kagune, questi ha un dialogo interiore con Rize. Urie parla a Mutsuki delle difficoltà di andare da solo ma all’improvviso, una crisi mette la città in allerta, costringendo la CCG e i ghoul a lavorare insieme.

Dopo la crescente attività dei draghi e la scoperta di un secondo nucleo, Kaneki e Ayato si offrono volontari per affrontarlo. Quando Kaiko e i membri di V lanciano un attacco, la CCG e i ghoul devono combattere insieme per fermarli.

Kaneki e Furuta continuano il loro duello sotto le strade di Tokyo, mentre la CCG e il Goat continuano a combattere insieme i membri di V in superficie. Kaneki viene a patti con se stesso e gli eventi che hanno cambiato la sua vita negli ultimi anni.