En 1995, Kiryu y sus amigos planean un robo a una sala de juegos para escapar de sus restrictivas vidas. Sin embargo, la misma estaba controlada por la familia Doujima, una organización que gobierna Kamurocho. En 2005, cuando Kiryu está a punto de salir de prisión, el detective Date le informa que sus amigos están en peligro, razón por la cual decide volver a Kamurocho para protegerlos.

En 1995, Kazama, el encargado del orfanato, esperaba que Kiryu, Nishiki, Yumi y Miho llevaran vidas honradas. Sin embargo, los cuatro terminan adentrándose en el mundo de la Yakuza. En 2005, la tensión entre el Tojo-Kai y la Alianza Omi llega a su límite tras un robo de diez mil millones de yenes.

En 1995, la familia Doujima acorrala a la hermana menor de Edgar, a quien se le confió el sello oficial necesario para vender sus terrenos. Mientras tanto, Yumi viaja a Osaka en busca de su hermana mayor. Al mismo tiempo, la batalla por el sello de Edgar se intensifica. En 2005, Aiko desaparece y deja sola a Haruka, su hija. Kiryu y Yumi deciden proteger a Haruka, pero pronto descubren algo.

En 1995, una Miho agotada cae gravemente enferma. Nishiki, muy preocupado por su hermana, se encuentra a merced de un plan de los Doujima que explota su vulnerabilidad. En 2005, mientras Kiryu y Yumi buscan a Aiko en Osaka, encuentran a Goda, el presidente de la Alianza Omi, el cual los obliga a prometer que devolverán los diez mil millones de yenes antes de la medianoche del día siguiente.

En 2005, Kazama se reúne con Goda, el presidente de la Alianza Omi, para evitar una guerra con el Tojo-Kai. Un conflicto no resuelto entre Kiryu y Nishiki de hace diez años resurge, abriendo una nueva brecha entre ellos. En 1995, Kiryu, que viene de una racha ganadora en la lucha clandestina para financiar la cirugía de Miho, llega por fin a la cima con una pelea de alto riesgo por el título.

En 1995, el vínculo entre Kiryu, Nishiki, Yumi y Miho, que se han apoyado como una familia, se desmorona trágicamente. 2005. ¿Podrá Kiryu evitar una guerra entre el Tojo-Kai y la Alianza Omi? ¿Cómo harán Kiryu y Nishiki para resolver su conflicto de hace diez años? ¿Cuál es la verdadera identidad del Diablo de Shinjuku? Con la tensión en aumento, se enfrentan a muerte en Kamurocho.