Minęło 15 lat, odkąd Erik Heller wywiózł Hannę – wtedy niemowlę – z tajnego rumuńskiego ośrodka. Dziś oboje żyją w lesie w Polsce. Erik wyszkolił Hannę na zabójczynię i łowczynię o niezwykłych zdolnościach. Dorastając w zamkniętym świecie, Hanna czuje potrzebę poznania okolicy. Jej wędrówki zwracają uwagę agentki CIA Marissy Wiegler, która ściga Hannę od jej narodzin.

Uwięziona przez ludzi Marissy w podziemiach obiektu CIA w Maroku Hanna musi uciec, by dołączyć do Erika w Berlinie. Dzięki temu poznaje Sophie, nastoletnią Brytyjkę spędzającą wakacje z rodziną. To ona daje Hannie zasmakować prawdziwego świata i dreszczyku dojrzewania. Jednak mimo posmaku normalności widmo Marissy i jej agentów pozostaje realne.

Hanna i Erik spotykają się w Berlinie, gdzie ukrywają się z jego dawnymi przyjaciółmi z wojska. Hanna dowiaduje się nieco więcej na temat przeszłości ojca. Nadal jednak tęskni za normalnym życiem, którego próbkę dała jej Sophie, i jest coraz bardziej sfrustrowana ograniczeniami narzucanymi przez ojca. Czując, że Marissa jest na ich tropie, Erik z przyjaciółmi zaczynają przygotowywać atak.

Erik więzi Marissę, próbując wynegocjować bezpieczny wyjazd z Berlina dla siebie i Hanny. Tymczasem Hanna ukrywa się u Dietera i jego rodziny. Zdecydowana dowiedzieć się więcej o planach ojca, odkrywa wielki sekret z własnej przeszłości. Podczas gdy plan ich ucieczki nabiera kształtów, Marissa próbuje realizować własny.

Wciąż jeszcze zszokowana swoimi odkryciami dotyczącymi Erika, Hanna ukrywa się na przedmieściach Londynu u Sophie, która zataja to przed rodzicami. Sophie namawia Hannę do udziału w imprezie, na której Hanna pierwszy raz doświadcza dreszczyku szczenięcej miłości. Tymczasem przyjaciele Erika desperacko walczą o jego życie wiszące na włosku po obrażeniach, jakie odniósł podczas ucieczki.

Relacje między Sophie i Hanną zaczynają się psuć z powodu zainteresowania ich obu Antonem. Tuż po ich kłótni w domu Sophie zjawia się Marissa udająca matkę Hanny. Hanna musi wybierać między narażeniem rodziny Sophie a poświęceniem swojej wolności i towarzyszeniem Marissie. Tymczasem Erik jest traktowany brutalnie przez Sawyera i jego ludzi.

Zdając sobie sprawę, że Hanna nie zaakceptuje niczego poza prawdą, Erik zabiera ją do Rumunii, żeby dowiedziała się czegoś więcej o swojej przeszłości. Tymczasem Marissa wyczuwa, że Sawyer nie mówił jej prawdy na temat losów Utrax.

Gdy Erik wyjawia Hannie prawdę o Utrax, ta postanawia wkroczyć do akcji. Tymczasem Marissa usiłuje wyciągnąć od Sawyera, co naprawdę dzieje się w obiekcie.