Inuyasha e il suo gruppo riprendono il cammino, quando si imbattono in un corteo sacrificale in procinto di offrire una vittima a una misteriosa divinità dell'acqua. Dopo aver scoperto che la vittima sacrificale è un bambino, decidono di aiutare gli abitanti a liberarsi della divinità crudele.

Durante un maldestro tentativo di ottenere i favori di una ragazza, Miroku viene ferito alla mano destra da un demone-mantide che si nascondeva nel corpo di lei. Resosi conto della gravità del danno subito e del rischio che corre, il monaco si fa condurre dal fido Hachiemon dall'anziano monaco Mushin, suo padre putativo, per farsi medicare la ferita.

Il perfido Naraku, convinto di non poter avvicinare Inuyasha a causa dello straordinario potere di Tessaiga, escogita un diabolico trucco per rendere inoffensivo il suo nemico. Utilizzando un frammento della Sfera dei Quattro Spiriti restituisce la vita a Kohaku, fratello di Sango, e controllando la sua volontà, lo trasforma in un mostro assassino.

Tentata dall'infame ricatto di Naraku, Sango sottrae Tessaiga a Inuyasha e si reca al palazzo del perfido demone, con la debole speranza di poter salvare il fratello tenuto in vita da un frammento della Sfera dei Quattro Spiriti, ma completamente asservito al male.

Inuyasha e Kagome si recano presso un campo dove viene coltivata un'erba medica indispensabile per curare Kirara, rimasta intossicata dopo aver morso Naraku. Il custode del campo è un enorme demone chiamato Jinenji che vive solo con la madre ed è accusato di essere un mostro sanguinario dagli abitanti del vicino villaggio.

La sacerdotessa Kikyo, ancora tenuta in vita dalle anime dei morti di cui si nutre, sta prestando soccorso ad alcuni samurai feriti, quando viene raggiunta da un vassallo di Kagewaki e scortata fino al palazzo del signore. Kagewaki, ovvero Naraku, è infatti costretto a letto dalla ferita causata dalla freccia di Kagome.

Inuyasha e i suoi compagni di viaggio si mettono ancora una volta alla ricerca di Naraku che ha appena ottenuto un nuovo corpo grazie alla stregoneria del Kodoku e ha rapito la sacerdotessa Kikyo.

Accompagnato da Myoga, un vecchio demone-fabbro di nome Totosai abbandona la propria abitazione per sfuggire alle ire di Sesshomaru. Quest'ultimo, infatti, gli aveva commissionato una spada che Totosai in realtà non ha la minima intenzione di forgiare.

Inizia una nuova sfida tra Inuyasha e Sesshomaru. Quest'ultimo ha intenzione di fare a pezzi Tessaiga utilizzando la potente zampa di un drago appena ucciso. Ma Inuyasha non ha intenzione di abbandonare la propria arma al suo destino e si impegna nel combattimento fino al punto di riuscire a vedere la cosiddetta "Cicatrice del Vento".

Inizia lo scontro tra Inuyasha e Koga, il giovane demone addestratore di lupi appartenente alla tribù Yoro. Nel momento in cui Inuyasha sta per vibrare il colpo definitivo con Tessaiga, Koga avverte il pericolo e, sfruttando la velocità consentitagli dai frammenti della Sfera, fugge insieme ai suoi lupi.

Kagome e Shippo sono sempre prigionieri della tribù Yoro. Shippo con una magia assume le sembianze di Koga e cerca di portare in salvo Kagome, ma l'inganno viene scoperto e grazie alla ragazza solo Shippo riesce a fuggire.

Kagome, arrabbiata con Inuyasha, è tornata a condurre la vita nel suo tempo: sta in casa con i familiari, frequenta le lezioni a scuola. Non riesce però a ritrovare il buonumore.

Dopo aver avvistato gli insetti demoniaci di Naraku mentre sottraevano un frammento della sfera a un immenso demone-orso, Inuyasha e i suoi compagni decidono di inseguirne lo sciame convinti di arrivare al palazzo di Naraku.

Mentre Sango e Miroku affrontano nel palazzo di Naraku un fantoccio creato con l'Arte del Simulacro, Koga e Inuyasha continuano il loro combattimento mortale. Inuyasha ha un braccio rotto, è debole, e Koga, con un frammento di luce diversa nel braccio destro, è più forte, e sembra a un certo punto aver ucciso l'avversario.

La giovane Koharu, una ragazzina di quattordici anni, per aver resistito alle pesanti avance del figlio di un ricco mercante soprannominato Aburachojya, è ora braccata dai suoi sgherri. In suo aiuto interviene Sango, cui si aggiungono Inuyasha e i suoi compagni di viaggio.

Kanna, il demone bianco emanazione di Naraku, fa assorbire dal suo specchio anche l'anima di Kagome. Intanto Inuyasha, debole anche a causa del braccio rotto, combatte contro Kagura: cerca la "Cicatrice del Vento", e non è ancora a conoscenza dell'esistenza di Kanna, che col suo specchio rispedisce ogni attacco al mittente.

Inuyasha, ferito, si tormenta al pensiero che Kikyo possa aver consegnato a Naraku la parte della Sfera dei Quattro Spiriti sottratta a Kagome. Mentre è immerso nei suoi pensieri, viene attratto dagli spettri che trafugano le anime dei morti che solitamente accompagnano Kikyo.

Raggiunto il luogo del combattimento tra Goshinki e Inuyasha, Sesshomaru recupera la testa del demone sconfitto e la porta da Kaijimbo, fabbro costruttore di spade un tempo ripudiato dal maestro Totosai a causa della sua propensione al male. L'intenzione di Sesshomaru è quella di ottenere una spada forgiata dalle zanne di Goshinki.

Completamente controllato dalla volontà della spada Tokijin, Kaijimbo sfida Inuyasha a duello, ma ben presto soccombe e muore, incapace di sopportare l'aura maligna della sua stessa spada. Nonostante la vittoria, Inuyasha è ancora alle prese con l'impugnatura di Tessaiga, divenuta insopportabilmente pesante dopo la riparazione di Totosai.

Il gruppo di Inuyasha si è finalmente messo in cammino, quando viene raggiunto da Koga, il demone lupo innamorato di Kagome. Tra lui e il gelosissimo Inuyasha scoppia subito una lite che si conclude con la fuga di Koga.

Inuyasha e Kagome litigano ancora per una sciocchezza, e mentre la ragazza se ne torna a casa Miroku e Sango se la prendono con Inuyasha.

Dopo aver assistito all'incontro tra Kikyo e Inuyasha, Kagome torna disperata nella sua epoca, dimenticando di lasciare nell'era Sengoku due frammenti della Sfera. Inizia per lei e Inuyasha una difficile separazione, che li aiuterà a far chiarezza nei loro sentimenti.

Il giovane Kohaku, tenuto in vita da un frammento della Sfera dei Quattro Spiriti, è riuscito a sfuggire dal controllo di Naraku e si è rifugiato presso la capanna di due anziani contadini, che gli offrono ospitalità. Ma ben presto abbandona quel luogo, deciso a ritrovare la memoria che ha irrimediabilmente perduto.

Kagura e il suo esercito di demoni è arrivato al cospetto di Inuyasha e Miroku, con l'apparente intenzione di riprendersi il frammento di Sfera che Naraku ha usato per far rivivere Kohaku, il fratellino di Sango. Ma Kohaku, che è stato privato della memoria da Naraku, ha in realtà ricevuto da questi l'ordine di uccidere Kagome.

Sesshomaru va a parlare con Bokuseno, lo spirito dell'albero di magnolia vecchio di duemila anni e da cui sono state forgiate le else delle due spade del grande demone padre di Sesshomaru e Inuyasha: Tessaiga e Tenseiga.