The 100/ハンドレッド(字幕版)

サンクタムを制覇したクラークと仲間たちは、人類最後の生き残りが平和に暮らすために、人々を統制してサンクタムを再建しようとする。サンクタムにはプライムの信者と信者ではない者や"ガブリエルの子"たちが集まり、考え方の違いからいつ争いが起きてもおかしくない状況が続く。

アノマリーに入ったエコーとガブリエルとホープは、ホープの不思議な過去を知る。湖から出たホープは、ディヨザとオクタヴィアと暮らしていた家に向かうと、バルドに行くための鍵を探し、ディヨザが無事か確かめるためにバルドに行くと言い出す。

レイヴンが管理するサンクタムの原子炉でジェームズが恋人と一緒にいると、原子炉に問題が発生する。コンピューターでの出力調節が上手くいかなかったため、ジェームズはコーラと手動で調節しようと格納庫に入っていく。その後、レイヴンは予想外の脅威に直面する。

謎の部外者がやって来る。彼らは、「人類最後の戦いに勝つにはクラークが必要で、クラークを迎えに来た」と言う。クラークは行方不明になった仲間を連れ戻すため、彼らのリーダーに会いに行くが、すでに移動した後で見つからなかった。クラークはレイヴンやジョーダンたちと共に仲間を救出しに行くことを決意する。

オクタヴィアとディヨザは、惑星バルドに連れて行かれる。ディヨザと引き離されたオクタヴィアは、すきを狙って逃走し、ちょうど使徒が降りてきたエレベーターに乗り込み、全力で脱出しようとするが、姿を消していた使徒に殴られて気を失ってしまう。

ディヨザは記憶を取り出すための拷問を受けていたが、すきを狙って脱出し、助けに来たホープやオクタヴィアと再会する。一方、サンクタムでは武器庫から銃が盗まれる。インドラは、マディを総帥として民の前に立たせようとする。そんな中、惑星ナカラに到着したクラークたちは、そこが恐ろしい場所であることを知る。

エコー、オクタヴィア、ホープ、ディヨザは、２人ずつに分けられて投獄される。ホープは脱出する方法を考えるが、ディヨザはホープが助けに来たことが気に入らず、不満そうな顔をする。一方、マーフィーとエモリは、仲間を集めているインドラに代わりラッセルの監視と、サンクタムのまとめ役という任務を与えられる。

クラークが新たな敵に立ち向かう中、地球を滅ぼした核ミサイルの秘密が判明する。囚人の若者が地球に送られた約100年前、地球は核ミサイルによって滅び、110億人もの命が失われた。しかしそれはビル･カドガンが計算していたことで、レベル12の人類のみがシェルターに入れるようになっていた。

オクタヴィア、エコー、ホープ、ディヨザは、アンダースの指揮下で使徒として訓練され、バルドの使徒になるために母性愛を捨てることを強制される。一方、ニッキーを先頭に、囚人たちは30人の人質を取って宮殿に立てこもる。ニッキーは放送で、マーフィー、ラッセル、レイヴンを呼び出し、放送を聞いたインドラも戻る。

正体を現したシェイドヘダことラッセルは、総帥と名乗り、ひとつの民を支配する。マーフィーたちが怪我人を救出している間に、ラッセルはマディの所に向かい、従うか死かの選択を迫り、従属させる。そんな中、インドラは"総帥の座"をめぐりシェイドヘダと対立する。

ベラミーは宇宙のどこにいるのか？彼はストーンが開いた時にドゥセットという使徒を巻き込みながら、エセリアという星に飛ばされていた。エセリアには森が広がり、遠くにはキノコ形の巨大な岩々が立ち並んでいるのが見える。彼は広大な景色を前に戸惑うが、何かがあると気づき、前に進む。

サンクタムでは闇の総帥が新たなリーダーとなり、マーフィー、エモリ、囚人や"ガブリエルの子"らに「従うか、従わないか」と問う。インドラはマディを救うためにシェイドヘダにひざまずくが、心の中では決して彼を総帥と認めてはいなかった。一方、クラーク、オクタヴィア、レイヴン、エコーは、新たな敵と戦う。

赤き陽がクラークの計画を頓挫させる。

クラークと仲間たちは、これまでに起こったすべての出来事を思い返し、新たな脅威が迫っていることに気づく。

クラークとオクタヴィアは、使徒たちが望みをかなえようとした時、決死の救出作戦を開始する。

いくつもの戦いや犠牲を乗り越え、ついにクラークと仲間たちは最後の戦いに挑む。果たして、人類は自らの価値を高めることができるのだろうか？