La tensión entre el Comisario y la Marquesa, disgustada por el enlace que se acaba de celebrar, aumenta cuando el Cardenal manifiesta su deseo de que el nuevo matrimonio se hospede en palacio. Gonzalo sigue la pista de un libro que puede ayudarle a desvelar el secreto de su familia. Satur, ha decidido viajar a las Américas en busca de Gabi y Estuarda.

La Marquesa recibe la visita del Conde de Lizana. Nuño debe ingresar en un seminario. El Comisario, le reta a batirse en duelo. El Cardenal entrega al Rey el medallón. Juan lo intenta todo para que Víctor renuncie a Margarita, pero nada lo hace cambiar de opinión. El marido de Margarita conoce la verdadera de identidad de Águila Roja.

La familia del difunto Marqués de Santillana despoja a la Marquesa de sus posesiones, que serán entregadas a Nuño cuando éste alcance la mayoría de edad, deben empezar una nueva vida en una humilde casa de campo. Águila Roja investiga los asesinatos de varias prostitutas que aparecen desangradas por una extraña herida en el cuello. Margarita parece ser el nuevo objetivo del asesino.

Águila Roja descubre el paradero del único Mogtinac que permanece en la villa. El héroe intenta frenar los desmanes de los hombres del Comisario. La Marquesa de Santillana recibe de la Reina el importante encargo de velar por la vida del heredero al trono, un niño de tres años al que unos conspiradores quieren asesinar.

Las gentes de la villa enloquecen cuando al anuncio de un eclipse solar se suma un extraño fenómeno: la imagen de la Virgen de la Verdad llora sangre. El Rey de Francia visita España y Lucrecia mantiene con él un encuentro íntimo. Margarita acepta la propuesta de Juan para casarse al día siguiente.

Margarita, encerrada en el refugio, no acude a su boda con Juan. Los campesinos, enloquecidos por la inminencia del Apocalipsis, han tomado el palacio y mantienen secuestradas a las mujeres. Margarita y Alonso continúan en el refugio subterráneo en el que se han encerrado para salvarse del fin del mundo. Solo Satur sabe dónde están.

Satur ayuda a Águila Roja a acceder a un misterioso castillo al que llegan conducidos por unas notas que Gonzalo descubre en el misal de su madre. En palacio, la visita de Rembrandt provoca emociones encontradas. Al comprobar que Margarita faltó a su boda de forma involuntaria, Juan se dispone a aclarar con Eugenia que su encuentro amoroso fue un error.

La muerte se ha cebado con los campesinos de Valderrobledo y se llevará también a los habitantes de la Villa si Águila Roja no lo remedia. Estuarda y su hijo Gabi han estado engañando a Satur. La Marquesa organiza un fastuoso baile en palacio. Durante el transcurso del mismo, el Cardenal Mendoza y el Comisario llevan a cabo un oscuro plan para ganarse el favor del nuncio papal.

El famoso pirata Richard Blake ha sido apresado después de muchos años asolando galeones españoles. El Rey prepara una ejecución ejemplar. Gonzalo pasa tantas noches fuera de casa que Alonso y Margarita empiezan a sospechar que se está viendo con alguna mujer. En palacio, Nuño empieza a interesarse por el sexo opuesto. La Marquesa se resiste a reconocer que su hijo ya no es un niño.

La Marquesa y el Comisario están desesperados. Nuño ha sido acusado de violar a la joven Beatriz y permanece encerrado a la espera de su ejecución. Por su parte, Águila Roja intentará conseguir pruebas para demostrar la inocencia de Nuño. Águila es picado por una serpiente venenosa.

Felipe Próspero, está gravemente enfermo y los médicos poco pueden hacer ya por él. La Marquesa de Santillana descubrirá que las intenciones de la madre Isabel para conseguir el favor del Rey no son lo que aparentan. Águila Roja y Sátur encuentran en la celda de Agustín una esfera de cristal con inscripciones numéricas.

Llegan unos feriantes a La Villa, Cipri organiza un espectáculo en la posada. Entre las actuaciones se encuentra la exhibición de “la bestia humana”. Gonzalo, indignado por el trato que recibe ésta, investiga su procedencia.

La peste asola la villa. Los hombres del Comisario detienen a todo aquel que tenga síntomas para frenar la propagación de la enfermedad. Sátur se ha contagiado y Águila Roja cuidará de su fiel escudero hasta el final. El barco dónde viajaba el pirata Richard Blake ha naufragado.