Seria wybuchów wstrząsa Gotham. Batman znajduje się w środku wojny o wpływy między szefami mafii: Rupertem Thorne'em i Pingwinką. W tym samym czasie komisarz Gordon wraz ze swoją córką Barbarą szukają sposobu, aby oczyścić z korupcji wymiar sprawiedliwości.

Kiedy znika czarująca gwiazda filmowa, Batman i pani detektyw Montoya zostają uwikłani w mroczną sieć tajemniczego mściciela, który prześladuje studia filmowe.

Po tym, jak ojciec-multimilioner trafia do więzienia zostawiając ją bez gotówki, dyletantka Selina Kyle poszukuje dreszczyku emocji. Schodzi na przestępczą drogę w przebraniu zuchwałej Kobiety Kota, za każdym razem unikając prawa. Batman planuje zakończyć jej łupieżczy szał, podczas gdy dwóch szemranych detektywów chce zobaczyć, jak złodziejka traci swoje dziewięć żyć za jednym zamachem.

Kiedy burmistrz Jessop powołuje grupę zadaniową, która ma złapać Batmana, na jej czele staje detektyw Montoya. Flass i Bullock biorą sprawy w swoje ręce, chcąc schwytać Batmana, przez co Gotham znajduje się w ognistym niebezpieczeństwie.

W Gotham ktoś porywa i robi pranie mózgu bogatym i wpływowym mężczyznom. Batman musi się dowiedzieć, kto i dlaczego. Kiedy Barbara Gordon zaczyna podejrzewać, że jej przyjaciółka może mieć z tym związek, śledztwo prowadzi do konfrontacji z Mrocznym Rycerzem.

Po serii rabunków w Gotham Batman musi przyjąć do wiadomości, że sprawca może przybywać z zaświatów. W tym samym czasie moralność Harveya Denta jest wystawiona na próbę, kiedy otrzymuje on hojną darowiznę na rzecz kampanii z podejrzanego źródła.

Po nieudanej próbie zamachu na życie komisarza Gordona Montoya przysięga, że zrobi wszystko, aby go ochronić. Śledztwo Batmana w sprawie tego, kto stał za zabójstwem, prowadzi do dziwacznej sytuacji, w której jedno jest pewne: nikomu nie można ufać.

Kiedy dzieci zaczynają znikać na wiecu wyborczym Harveya Denta, Batman węszy za kulisami wesołego miasteczka, gdzie odbywa się wiec i odkrywa coś o wiele groźniejszego.

Po wypadku Harveya Denta Batman i Bruce Wayne muszą powstrzymać prokuratora, który postanawia po swojemu wymierzyć sprawiedliwość.

Odcinek finałowy to próba zapewnienia bezpieczeństwa Harveyowi Dentowi przez Barbarę Gordon i Batmana, dopóki ten nie złoży zeznań w sądzie. Doprowadza to jednak do otwartej wojny między bohaterami i złoczyńcami Gotham.