En el año 2017 del Calendario Imperial, Japón ha sido conquistado por Britannia y renombrado como Área 11. Lelouch, un príncipe exiliado, obtiene el poder del Geass de una misteriosa chica llamada C.C., permitiéndole controlar a otros. Adoptando la identidad de Zero, lidera la resistencia contra Britannia, enfrentándose a su viejo amigo Suzaku, ahora soldado del imperio.