MacGyver

In de eerste aflevering van seizoen twee moeten MacGyver en zijn team met behulp van een mobieltje en een voetbal een Navy SEAL opsporen die in gevangenschap schijnt te verkeren in het Midden-Oosten.

Mac en het team proberen met een ketting en een microgolfzender Riley op te sporen als haar eerste klus met een groep gevaarlijke hackers uit de hand is gelopen.

MacGyver en het team moeten met behulp van manchetknopen en een snoer undercover diamanten zien te stelen uit een casino, voordat een groep terroristen de juwelen kan inruilen voor massavernietigingswapens.

Murdoc drogeert MacGyver en ontvoert hem. Mac gebruikt een naald en zijn tanden om te ontsnappen en samen met het team het volgende slachtoffer van Murdoc te redden.

Het team moet zijn Halloween-plannen staken als ze de beruchte Bermuda-driehoek in moeten om de zoon van de vicepresident te redden, nadat zijn vliegtuig is gecrasht met een mysterieuze gevangene aan boord.

Mac en het team proberen met een cassetterecorder en een plastic emmer een enorme brandende oliebron in een Nigeriaans dorp te blussen. Die is door een rebellengroep in brand gezet, die de regering wil afzetten door haar meest waardevolle natuurlijke bron te vernietigen.

MacGyver gebruikt een kachel en tabasco om een belangrijke presidentskandidaat in Ecuador aan een donorhart te helpen als een rebellengroep de levering van het orgaan heeft gedwarsboomd.

MacGyver en Jack 'stelen' een onbetaalbaar schilderij met een tafelkleed en een schoenveter, om een beruchte kunstheler uit zijn tent te lokken, maar het schilderij komt in handen van het team van de heler. Riley's vader Elwood (Billy Baldwin) vraagt of ze weer contact met hem wil hebben en Matty stuurt Bozer naar een kamp voor spionagetraining.

Mac en het team volgen een groep Indonesische huurlingen die een dodelijke hoeveelheid gestolen zenuwgas vervoeren, in de hoop dat ze zo terechtkomen bij hun gevaarlijke leider. Jack vraagt Elwood naar zijn plannen met Riley en Bozer wordt in zijn spionageschool tot het uiterste gedreven.

Als 32 studenten vastzitten op een onderzoeksschip in de Noordelijke IJszee zonder verwarming en met uitbrekende brandjes, bouwt Mac via videochat een band op met de groepsleider, in zijn pogingen ze in leven te houden tot er hulp komt. Jack ontvoert Elwood om achter zijn plannen te komen en Bozer groeit dichter naar Leanna toe.

De LAPD onderbreekt de kerstviering van het team om Mac te arresteren wegens terrorisme als ze een lichaam vinden in een gebouw dat is vernietigd met een bom die Mac heeft gebouwd.

Mac en Jack zitten vast in Macs huis waarin Macs aartsvijand The Ghost overal explosieven heeft aangebracht. Mac gebruikt een karaokemicrofoon en een audiotransformator om het team te laten weten dat dit ze moet afleiden van een grotere bom. We zien in flashbacks wat de omstreden ontmoeting van Mac en Jack inhield.

Mac doet mee met de opdracht voor overheidsagenten om vechtmachines te maken en moet zijn grootste concurrent Allie helpen (Ashley Tisdale) als haar robot wordt gehackt en op weg is naar het Pentagon. Jack gaat naar de reünie van zijn middelbare school in de hoop de man te treffen hem destijds aftroefde als homecoming-koning.

Het team gaat naar New Orleans om de oplichter (Amy Smart) op te sporen die zich voordoet als de vrouw van 'graaf Jacoby', een oude CIA-alias van Jack. Jack komt in gevaar als de oude vijanden van de zogenaamde graaf op wraak zinnen.

Als een van Murdocs huurmoordenaars Murdoc aan MacGyver wil overleveren in ruil voor 10 miljoen dollar, moet het team Murdoc beschermen tegen zijn vroegere mentor Nicholas Helman, die hem wil ombrengen. Jack beseft dat hij nog gevoelens heeft voor Diane, de moeder van Riley (Michael Michele).

MacGyver, Leanna, Riley en Bozer doen zich voor als stellen op huwelijksreis in een resort, om de net getrouwde zoon van een Servische oorlogsmisdadiger uit te horen over zijn vader. Bozer vraagt zich af of Matty weet dat hij een relatie heeft met Leanna en Jack vraagt Elwood (Billy Baldwin) om hulp als hij bij Matty wil inbreken.

Mac, Jack en Riley zoeken een maffioso die informant is geworden, als hij ontvoerd is en naar Tsjernobyl is vervoerd door een internationale onderwereldfiguur die bang is dat hij belastende informatie aan de CIA zal doorgeven. Het kost Bozer moeite om iets achter te houden voor Matty.

Als Matty en het team een voormalige overheidstechnoloog zoeken die geheime informatie heeft gestolen en op de vlucht is, komen ze weer terecht bij de Coltons, de familie premiejagers die hem ook zoeken, maar om andere redenen.

Mac en het team onderzoeken de dood van de CIA-supervisor van Dawn (Amy Smart), wat ze naar een corrupte CIA-agent en een enorm netwerk van vervalsers leidt.

Mac en Jack proberen de zoon van een miljardair te redden die ontvoerd is door een voormalige Navy SEAL die met een EMP-wapen de stroom en communicatiemiddelen heeft uitgeschaked van de wolkenkrabber in Sjanghai waarin de jongen woont.

MacGyver is in Puerto Rico om zijn vriend te helpen, wiens huis is verwoest door een orkaan. Hij wordt gegijzeld in de bank waarvan zijn vriend directeur is, als bankrovers er twee miljoen dollar proberen te stelen.

Mac en Riley worden belaagd door een groep gemaskerde mannen als ze voor de overheid een mysterieus voorwerp willen onderzoeken dat in de woestijn van Nevada is gecrasht.

In de laatste aflevering van het tweede seizoen wordt MacGyver onaangenaam verrast als hij Matty wil vertellen dat hij weg wil bij de Phoenix Foundation.