꼭두각시 서커스

아버지를 사고로 잃고 막대한 유산을 상속받은 소년 사이가 마사루. 그런 마사루와 우연히 만난 청년 가토 나루미는 마사루를 도와주기로 한다. 하지만 마사루를 쫓아온 것은 뛰어난 전투 능력을 갖춘 인형사들이었다. 나루미가 맞서보지만 결국 궁지에 빠진 두 사람. 마사루가 고함을 질러 도움을 청했을 때, 그들 앞에 마리오네트를 조종하는 은발의 미녀 시로가네가 모습을 드러낸다.

잠시 숨을 돌리지만, 다시 인형의 습격을 받는 나루미와 친구들. 피에로 모양의 마리오네트 풀치넬라를 조종하는 킬러 아시하나 에이료가 쳐들어온다. 시로가네는 마리오네트 아를르캥을 조종하며 맞서 싸우지만, 숨어 있던 아시하나의 일당이 마사루를 덮친다.

반복되던 습격 끝에 결국 마사루는 가루이자와로 납치되고 만다. 나루미와 시로가네는 마사루를 구출하려고 납치의 배후인 마사루의 삼촌 사이가 젠지의 저택에 잠입한다. 한편 저택에서 탈출을 시도하던 마사루는 그 와중에 돌아가신 아버지 사이가 사다요시가 남긴 파일을 발견한다.

삼촌인 젠지에게서 벗어나려면 울보에서 강한 사람으로 다시 태어나야 한다고 새로이 다짐하는 마사루. 그때 자신을 노리던 아시하나와 다시 만나는데, 도망치지 않고 오히려 자기편이 되도록 제안한다. 한편, 나루미와 시로가네는 젠지가 고용한 인형사에게 붙잡혀 절체절명의 위기를 맞는다.

몇 번이나 찾아온 고비에서 마사루를 지킨 나루미였지만, 저택의 폭발에 휘말려 실종된다. 마사루는 크게 상심하지만, 나루미에게 배운 대로 강하게 살겠다고 결심하고, 일상적인 학교생활로 돌아간다. 한편 시로가네는 그런 마사루를 지켜보기 위해 마사루가 다니는 초등학교 옆에 있는 고등학교에 편입한다.

가루이자와에서 소식이 끊어진 나루미가 깨어난 것은, 어느 병원의 병실. 거기서 나루미는 여자를 밝히는 아니꼬운 남자 기이와 노파 루실을 만난다. 사고의 충격으로 나루미는 기억을 잃었는데, 입원 중인 아이들과 만나 신기할 정도로 빠르게 아물어 가는 자신의 상처를 보며 이상하게 느낀다.

희귀병인 조나하 병의 진실, 그리고 조나하 병을 퍼뜨리는 원흉, 한밤중의 서커스의 존재를 안 나루미. 아이들의 미래를 빼앗는 자동인형을 쓰러뜨리기 위해, 나루미는 자동인형 파괴자 = '시로가네'가 되기로 결심한다. 한편, 나카마치 서커스와 함께 행동하는 마사루와 시로가네는 의문의 여성 빌마와 마주친다.

새로운 동지로 칼잡이 빌마가 가세한 나카마치 서커스는 모아놓은 흥행 자금으로 이즈에서 드디어 공연을 올리게 된다. 이윽고 공연이 시작하던 그때, 태평양 상공에서는 나루미, 기이, 루실이 한밤중의 서커스의 흔적을 찾아, 상하이로 가는 비행기에 탑승해 있었다. 그러나 기내에는 자동인형도 타고 있어 격렬한 교전 상태에 빠지고 만다.

자동인형과 싸우다가 상처를 입어 바다에 빠진 기이를, 나카마치 서커스 사람들이 구한다. 놀랍게도 기이는 시로가네의 마리오네트 스승이었다. 기이와 만난 것을 계기로 시로가네의 마음을 알게 된 마사루는 자신의 출생의 비밀을 밝히기 위해 홀로 여행을 떠난다. 한편 중국에 도착한 나루미와 루실은 단서를 찾다가 나루미의 중국 권법 스승인 량을 만난다.

량이 말해주는 과거의 진실. 일찍이 연금술에 뜻을 품었던 청년 진과 인 형제. 그들이 만나고, 그리고 서로 사랑한 프란시느라는 여성. 세 사람의 엇갈린 마음 때문에, 희귀병인 조나하 병은 프랑스의 어느 마을에 퍼뜨려진 것이었다. 진실을 안 나루미와 친구들 앞에, 가장 오랜된 4인으로 불리는 자동인형의 하나 판탈로네가 모습을 드러낸다.

중국에서의 사건을 계기로 한밤중의 서커스의 소재지가 마침내 발견된다. 장소는 사하라사막. 한밤중의 서커스를 섬멸하려고 전 세계에서 사하라사막에 모이는 시로가네들. 나루미는 거기서, 신체 일부를 기계화한 시로가네-O들을 통솔하는 페이스리스 사령관과, 사막 지대에서 활약하는 시로가네와 파티마 등을 만난다.

한밤중의 서커스의 텐트 안에서, 메리 고 라운드 오르센과 아크로바트 브라더스에 승리한 나루미들. 다음에 나타난 것은, 어느 한쪽이 프란시느 인형의 방으로 이어진다는 두 개의 문. 나루미들은 양쪽으로 갈라져 돌파하려 하지만, 문 앞에는 새로운 적이 기다리고 있었다.

텐트 중심까지 가자 마침내 나루미와 친구들은 프란시느 인형을 보게 된다. 그러나 인형에 도달하려면 가장 오래된 4인을 넘어뜨려야 한다. 콜럼빈이 만신창이가 된 나루미를 덮쳤을 때, 프란시느 인형을 파괴하려는 목적 하나로만 연결되어 있던 시로가네들이 한마음으로 나루미를 지켜낸다.

격전 중에 하나씩 하나씩 꺼져가는 목숨. 나루미도 생사의 갈림길에서 헤매고 있었다. 그런 나루미를 구하려고 목숨을 건 수술에 도전하는 로컨필드. 한편, 프란시느 인형과 똑같이 생긴 안젤리나 인형에 의해 움직임이 봉인되었던 알레키노와 판탈로네가 마침내 자유를 되찾는다. 점차 형세가 나빠지는 가운데, 동료들의 힘과 마음을 이어받은 나루미가 드디어 눈을 뜬다.

자신의 출생의 비밀을 알아내기 위해, 홀로 나카마치 서커스를 떠나는 마사루. 찾아간 곳은 예전에 어머니와 살았던 아파트다. 마사루는 어머니가 죽은 후, 사이가 가문에 끌려간 것을 생각해 내지만, 아버지 사다요시의 얼굴은 아무래도 생각나지 않는다. 계속 이동해 가던 중, 할아버지인 쇼지와 나눈 대화를 떠올린 마사루는 자신이 다시 태어난 시작의 장소인 꼭두각시 저택으로 향한다.

가라쿠리 저택에서 공격해온 구로가 인형술사에 잡혀있는 마사루. 정신을 차려보니 눈앞에는 돌아가셨던 상냥한 할아버지 쇼지가 있었다. 그러나 쇼지는 마사루를 아버지 이름인 사다요시로 부르며 적개심을 보인다. 마사루는 생명의 물을 머금은 쇼지의 피를 억지로 마시게 되고, 쇼지의 기억을 체험하게 된다. 때는 덴포. 장소는 나가사키. 쇼지는 동네 의사로 일하고 있었다.

쇼지의 기억을 여행하는 마사루가 본 것. 쇼지는 생명의 물을 마시고, 안젤리나와 함께 살기로 한다. 시로가네를 돕기 위해, 마리오네트 연구에 몰두하는 쇼지. 그리고 쇼지의 곁을 지키는 안젤리나. 어느 날, 쇼지가 만든 마리오네트를 전 세계의 시로가네에 적용하기 위해, 루실의 명을 받은 딘 메스트르라는 남자가 프랑스에서 찾아온다.

쇼지와 안젤리나의 딸 엘레오놀이 세상에 태어났다. 엘레오놀의 출생을 계기로 조금씩 태도가 변하는 기이와 프란시느 인형. 모두가 행복을 느끼고 있었다. 그러나 그것도 잠시, 섬뜩한 기계음과 함께 자동인형이 구로가 마을을 습격한다.

기억 여행에서 돌아온 마사루는 자신이 사다요시가 아님을 증명하기 위해, 구로가 사람들을 따돌리고 저택에서 밖으로 뛰쳐나간다. 그때, 마사루를 찾아 구로가 마을에 온 시로가네와 우연히 재회한다. 그러나 기이와 추격자를 피하던 중, 또다시 쇼지의 기억이 머릿속을 맴돈다. 기억 속에서 엘레오놀은 안젤리나의 바람도 헛되이 생명의 물을 마시고 말았다.

자기 뇌의 정보를 마사루에게 다운로드해서 엘레오놀과 맺어지는 것. 그것이 사다요시의 목적이었다. 쇼지의 기억 전부를 알게 된 마사루는 많은 이들의 이뤄지지 않은 소망에 눈물을 흘린다. 그런데도 여전히 마사루를 사다요시라고 단정 짓는 쇼지와 기이. 결국에는 기이가 마사루를 향해 칼을 겨눈다. 그 순간, 예기치 않게 구로가 사람 중 하나가 끼어들어, 쇼지도 몰랐던 진실을 말하기 시작했다.

세월을 뛰어넘고 모습을 바꾸며 자신의 소원을 이루기 위해 운명을 조작하던 인물. 그것은 페이스리스의 모습으로 나타난 바이진이었다. 시로가네를 납치해 모습을 없앤 페이스리스는 거대한 은빛 여신을 전 세계에 출현시킨다. 거기서 뿌려지는 조나하병. 분노와 슬픔에 몸서리치는 마사루는 잭 오 랜턴에 뛰어들어 여신을 추격한다. 그러나 실체가 없는 여신에게는 전혀 통하지 않는다. 조나하병의 만연을 어떻게든 막기 위해 마사루는 기이, 리제와 함께 페이스리스를 쫓는다.

조나하병의 치료 머신인 해리를 지키기 위해 연구소에 도착한 나루미 일행. 톰을 인질로 잡힌 밍시아는 자동인형 존스와 교전 상태에 돌입한다. 존스의 공격에 속수무책인 밍시아였지만, 죽은 아버지나 루실을 떠올리며 분발한다. 그 무렵, 잡혀있던 시로가네는 자신을 프란시느라고 부르며 떠받드는 콜럼빈, 판탈로네, 알레키노에게 들볶이고 있었다.

싸움이 계속되는 조나하병 연구소. 조지는 신형 시로가네-O인 슈나지와 격돌하지만, 전혀 상대도 되지 않는다. 그런 조지에게 페이스리스 편에 붙은 이유를 밝히는 슈나지. 한편, 아시하나는 사하라에서 악연이 있었던 판탈로네에게 싸움을 건다. 공격 분석과 푸의 조언에 힘입어 돌파구를 찾는 듯했지만, 그보다 한발 앞서가는 판탈로네에게 점차 압도당한다.

마침내 조나하병의 치료 머신인 해리가 있는 곳에 도착한 나루미와 밍시아. 그러나 범버트 등 연구자들은 두 개의 자동인형인 블롬 블롬 로와 드릴 셉템버의 공격을 받아 빈사 상태다. 한시라도 빨리 치료하기 위해 두 패로 갈라져 싸우지만, 밍시아가 블롬 블롬 로의 칼날에 쓰러지고 만다.