Nos deux héros font tout pour améliorer leurs compétences de Dresseurs, en participant à la compétition de la Coupe Marc ou en s'inscrivant aux cours d'été de l'Académie Pokémon. Heureusement, les tactiques qu'ils y apprendront les aideront à déjouer le dernier complot de la Chasseuse de Pokémon J et à affronter la Team Galaxie !