I 1995, planlægger Kiryu og hans venner, der gerne vil undslippe deres restriktive liv, et kup mod en lokal arkade. Men arkaden kontrolleres af Doujima-familien, en magtfuld yakuza-organisation, der kontrollerer Kamurochō. I 2005 bliver Kiryu løsladt fra fængsel, og kriminalbetjent Data fortæller ham, at hans venner er i fare, og han vælger at vende tilbage til Kamurochō for at beskytte dem.

1995. Kazama, der driver Sunflower børnehjem, havde håbet, at Kiryu, Nishiki, Yumi og Miho ville leve ærlige liv. Imidlertid kastes de fire, i strid med hans ønske, ned i yakuzaens underverden. I 2005 er spændingerne mellem Omi-alliancen og Tojo-klanen på kogepunktet på grund af et kup til ti milliarder yen.

1995. Doujima-familien nærmer sig Edgars lillesøster, der blev betroet det officielle stempel, der er nødvendigt for at sælge hans jord. I mellemtiden rejser Yumi til Osaka for at finde sin forsvundne storesøster. Samtidigt eskalerer kampen om Edgars stempel. I 2005 forsvinder Aiko og efterlader sin datter Haruka. Kiryu og Yumi beslutter sig for at beskytte Haruka, men de gør snart en opdagelse.

I 1995 bliver en overanstrengt Miho syg. Nishiki, der er dybt bekymret for sin lillesøster, er prisgivet Doujimas komplot, der udnytter hans sårbarhed. I 2005 møder Kiryu og Yumi, der fortsætter deres søgen efter Aiko i Osaka, Omi-alliancens formand Goda, der tvinger dem til at love, at de vil aflevere ti milliarder yen ved midnat den følgende dag.

I 2005 møder Kazama Omi-alliancens formand Goda i et forsøg på at forhindre en krig med Tojo-klanen. Den ti år gamle, uløste konflikt mellem Kiryu og Nishiki kommer til overfladen igen og skaber igen splittelse mellem dem. I 1995 når Kiryu, der havde haft en stime af sejre i undergrundskampe for at finansiere Mihos operation, endelig toppen med en titelkamp med høje indsatser.

1995. Båndet mellem Kiryu, Nishiki, Yumi og Miho, der havde været der for hinanden som familie, falder tragisk fra hinanden. 2005. Kan Kiryu forhindre en krig mellem Tojo-klanen og Omi-alliancen? Hvordan vil Kiryu og Nishiki løse deres ti år gamle konflikt? Og hvem er the Shinjuku Devil i virkeligheden? Spændingerne øges, og de står overfor den endelige kamp i Kamurochō.