Stargate Atlantis

Sheppard ja Ronon jämähtävät luhistuneeseen rakennukseen samalla kun McKay sekä Lorne jumittuvat toisiin raunioihin. Michaelin wraith-risteilijä ampaisee kohti rakennusta Carterin johtaessa pelastustehtävää. Kumpi ennättää heidän luokseen ensin?

Kun tri Keller ei ilmoittaudu työvuorolle, huolestuneet tiimiläiset löytävät järkytyksekseen Kellerin tajuttomana huoneestaan. Atlantiksen tilanteen kärjistyessä Woolsey joutuu sellaisen valinnan eteen, joka saattaa maksaa Kellerin hengen.

Ollessaan tehtävällä toisella planeetalla Ronon (Jason Momoa) joutuu väijytykseen ja jää entisen ystävänsä Tyren (Mark Dacascos) vangiksi. Ronon luovutetaan wraitheille, ja hän altistuu tuskalliselle koetukselle tiimin haravoidessa johtolankoja.

Daedalusin salamyhkäisen kopion viallinen ajuri lähettää tiimin vaihtoehtoisten todellisuuksien halki. Siellä he kohtaavat viheliäisiä muukalaisolentoja, polttavan auringon ja Atlantiksen yllä käytävän suuren avaruustaistelun.

Lukuisten poikkeamien ja virtahäiriöiden jälkeen Atlantis-tiimi joutuu mahdottoman valinnan eteen: joko salaperäinen olento päästetään vapaaksi tai sen annetaan tehdä tuhojaan systemaattisesti kaupungin tietokonejärjestelmissä.

McKay sairastuu selittämättömästi paluulennolla Atlantikseen. Pahinta pelkäävä lääkäri kutsuu McKayn sisaren jättämään hyvästit. Ronon kertoo Jeannielle pyhäköstä, jonka avulla Rodney saisi olla oma itsensä vielä yhden päivän ajan ennen kuolemaansa.

Tri Beckettiä (Paul McGillion) pyydetään viivästämään lähtöään Atlantiksesta, kun käy ilmi, että majuri Anne Teldy (Christina Cox) ja hänen tiedustelupartionsa ovat löytäneet Michaelin hylätyn labran laajasta maanalaisesta katakombista.

Keller ja Atlantis-tiimi esittävät Todd-wraithille hätkähdyttävän ehdotuksen: Keller uskoo löytäneensä “parannuskeinon” wraithien ihmislihanhimoon. Läpimurtohoito vaatii kuitenkin koekaniinin.

McKay ja Ronon tarjoutuvat auttamaan tri Jennifer Kelleriä lääkärintarkastuksessa Atlantiksen ulkopuolella. Kun kaksikko palaa Kellerin luokse myöhemmin, he kuulevat yllätyksekseen hänen lähteneen aiemmin. Hänestä ei löydy jälkeäkään kylässä.

Tähtiportti SG-1:n tri Daniel Jackson (Michael Shanks) matkaa Atlantikseen, kun tutkimuksissa käy ilmi, että muinaisia vastaan kapinoinut tiedemies Janus (Gildart Jackson) saattoi kätkeä labran jonnekinpäin kaupunkia.

Jackson ja McKay käynnistivät uudelleen Atteron, wraithien tuhoamiseen tarkoitetun muinaislaitteen. Näin heille valkenee syy siihen, miksi laite hylättiin lopulta. Samalla Todd pitää Daedaluksen miehistöä yhä vankina.

Eversti Sheppard tiimeineen paikantaa tri Carson Beckettin muukalaisplaneetalle, jossa tämä hoitaa pientä Hoffin rutosta selvinnyttä eloonjääneiden joukkoa. Samana iltana saapuu wraith-soturien seurue, mikä tietää täydellistä tuhoa.

Uutukainen galaktinen koalitio kutsuu everstiluutnantti John Sheppardin tiimeineen edustamaan Atlantista seuraavassa kokouksessaan. Saapuessaan tiimi pidätetäänkin välittömästi, ja he joutuvat oikeuteen syytettyinä rikoksista ihmisyyttä vastaan.

Atlantikseen lankeaa yhtäkkiä pimeys, jolta välttyy ainoastaan keskitornin ylin kerros. Sinne pyrkiessään Sheppard ja McKay saavat selville, että heidän kulkunsa estämiseksi on pystytetty voimakenttä.

Richard Woolseylla (Robert Picardo) on vaikeuksia säilyttää Atlantiksen johtajuus itsellään. Samalla McKay (David Hewlett) ja Zelenka (David Nykl) tutkivat salaperäistä löytöä. Sheppardin kaappaa vanha vihollinen, joka aikoo hyökätä kaupunkiin.

Atlantis-tiimi saa kahden viikon loman. Tri Rodney McKay suostuu vastentahtoisesti entisen kilpailijansa Malcolm Tunneyn kutsuun. Tämä väittää järjestämäänsä tieteellistä näytöstä ratkaisuksi ilmastonmuutokseen.

Tiimi varautuu pahimpaan noustessaan Atlantiksen yllä leijuvaan wraithien pesäalukseen. Yllätyksekseen he löytävät wraith-miehistön staasissa. Sitten toimintahäiriö vapauttaa loput miehistön jäsenet, jotka ovat syöneet toisiaan.

Tri Jennifer Kellerin havaitaan käyttäytyvän todella oudosti. Laajamittaisissa kokeissa ei paljastu poikkeamia. McKayn tutkimukset saavat hänet epäilemään, että tri Keller ja pahamaineinen rikollinen Neela Casol ovat vaihtaneet tajuntoja keskenään.

Vaihtoehtoisessa universumissa etsivä John Sheppard alkaa tutkia outojen murhien sarjaa Las Vegasin poliisilaitoksen palveluksessa. Murhia pidetään eriskummallisen sarjatappajan tekosina. Onko elämä muuttunut, vai onko tämä wraithien juoni?

Pesäaluksen äkillinen poistuminen kummastuttaa tiimiä. He havaitsevat aliavaruudessa heikon wraith-koodatun signaalin. Kun se on purettu, heidän pahin pelkonsa toteutuu. Wraithien viesti sisältää tutut koordinaatit: pesäalus on matkalla Maahan!