Det är 1962, USA har förlorat andra världskriget; östra delen ockuperas av Tyskland och västra av Japan. Bland förtrycket finns nytt hopp - filmer som tycks visa en annan värld. När hennes syster ger henne en film och sedan blir mördad, börjar en kvinna tro att filmerna visar hemligheten med friheten, och blir besatt av att finna deras mystiska väktare, Mannen i det höga slottet.

Franks öde hänger på en tråd då hans hålls fängslad av Kempeitai. Under tiden får Juliana kontakt med en mystisk man som ger henne en ledtråd om filmerna, och Obergruppenführer Smith blir tagen på sängen av en olycklig händelseutveckling.

Joe och Juliana måste handla snabbt då en illasinnad prisjägare som kallas The Marshal kommer till Canon City. Tagomi och Wegener planerar att föra ut värdefulla hemligheter från Riket, och Frank smider planer på hämnd mot japanerna.

Joe blir allt mer kluven mellan plikten och sina växande känslor för Juliana. Ed försöker hindra Frank från att fatta ett oåterkalligt beslut. Smiths utredning avbryts när han förlorar sitt vittne, och Tagomis plan går snett då en dramatisk händelse inträffar vid kronprinsens tal.

Juliana återvänder hem, bara för att upptäcka nya ledtrådar som för henne närmare lösningen på gåtan bakom filmerna. Under tiden genomgår Joe en hård utfrågning på nazisternas högkvarter. Kido börjar utreda händelseutvecklingen under kronprinsens tal, medan Tagomi och Wegener gör ett sista desperat försök att lyckas med den hemliga överföringen.

Joe firar VA-dagen hemma hos Smith, och passar på att ta reda på mer om filmerna. Juliana börjar arbeta åt Tagomi medan hon fortsätter sitt sökande efter svar. Smith bjuder hem en gammal vän för att delta i firandet, vilket får överraskande resultat.

Juliana gör en häpnadsväckande upptäckt om sin systers död. Frank reflekterar över nyligen inträffade händelser och fattar ett viktigt beslut om sin framtid, och Tagomi får veta mer om Julianas förflutna.

Då nätet dras åt, gör Juliana och Frank upp planer på att undkomma Kempeitais klor, bara för att åter hamna i farozonen då Joe försöker komma över en ny film. Under tiden sätts Smiths lojalitet på det slutgiltiga provet då han gör en häpnadsväckande upptäckt om sin familj, och Childan tänker hämnas på Kasouras genom att lura dem.

Tiden börjar rinna ut och en desperat Frank tvingas sätta livet på spel för att rädda Joe. Pusselbitarna faller på plats för Smith då han upptäcker vilka som låg bakom attacken mot honom själv. Tagomi blir förkrossad då han konfronteras med resultatet av sina intriger, och Kidos utredning leder till en viktig upptäckt om mordförsöket.

Då allt fler sanningar kommer i dagen, tvingas Juliana fatta sitt livs svåraste beslut. Wegener återvänder till Tyskland för att genomföra sitt hemliga självmordsuppdrag. Smith tar risken att bli skjuten då han går på jakt med den person som försökte döda honom, och Kido försöker desperat lösa fallet innan tiden är ute.