La începutul serialului, Mason Kane și Nadia Sinh - agenți de vârf ai organizației de spionaj Citadela - se confruntă cu un grup nou, infam - Manticore - și rezultatul este catastrofal. După opt ani, Mason Kane duce o viață liniștită drept "Kyle Conroy", fără să amintirea trecutului. Până când un vechi coleg îi cere ajutorul pentru a împiedica puternicul Manticore să creeze o nouă ordine mondială

Kyle și Bernard merg în New York City pentru a fura Geanta X a Citadelei din sediul Manticore. Apoi, Kyle află că o persoană din trecutul său încă trăiește și riscă totul ca să o găsească.

După ce Kyle și Nadia ajung la o veche casă conspirativă, mici indicii ale trecutului lor împreună ies la suprafață. Curând, ei descoperă că un fost aliat care ar putea fi cheia opririi Manticore este închis în Maroc. Pentru a îl salva, trebuie mai întâi să obțină ajutorul unui mafiot local. Dar misiunea lor e compromisă și ies la iveală secrete din trecut.

După revelația șocantă a fostei identități a lui Abby, aflăm despre fostele relații dintre Mason, Nadia și Celeste și o decizie teribilă care are efecte și azi. Între timp, Nadia și Kyle aterizează la complexul Manticore din Maroc și își riscă viețile pentru a își elibera colegul spion. Dar bucuria eliberării este scurtă și trebuie să se confrunte cu o acuzație periculoasă.

Nadia, Kyle și Carter sunt obligați să lucreze împreună pentru a scăpa din Manticore și să protejeze Geanta X, dar suspiciunile unuia dintre eroi ating punctul culminant, ducând la o mărturisire explozivă.

În finalul epic al sezonului, cu unul dintre ai lor ținut ostatic de Manticore, Kyle, Nadia și Carter riscă totul pentru a îl salva și a dejuca planurile Manticore de a obține arme nucleare. În timp ce eroii noștri luptă cu amenințarea nucleară, identitatea cârtiței din Citadela va fi relevată, ca și adevărul oribil că tot ce știu e o minciună.