Seis meses después del final de "Crows-Zero", Genji sigue obsesionado con derrotar a Rindaman. Mientras tanto, Serizawa observa cómo el instituto Suzuran sigue huérfano de un líder que agrupe a todos los estudiantes bajo una misma bandera. Lo que nadie prové es que el instituto Hosen, enemigo de Suzuran, está dispuesto a reanudar la guerra que se mantiene abierta desde hace años.
