Cehennemin ateşlerinde doğan Hellboy, iyi yürekli Dr. Bloom tarafından (John Hurt) kötülerin elinden kurtarılıp kahraman olarak yetiştirilir. Dr. Bloom'un Doğaüstü Araştırmalar ve Savunma Bürosu'na bağlı çalışan telepat deniz adamı Abe Sapien (Doug Jones), Hellboy ve gizliden gizliye âşık olduğu Liz Sherman (Selma Blair), insanlığı yok etmek isteyen doğaüstü kötü güçlerle savaşırlar.
