Lone Survivor forteller historien om fire Navy SEAL-soldater på et skjebnesvangert oppdrag for å fange eller drepe den beryktede Talibanleden Ahmad Shahd i Hindu Kush-regionen i Afghanistan. Oppdraget får en uheldig vending da gruppen blir utsatt for et bakholdsangrep som får alvorlige følger. Den lille gruppen blir isolert og er omringet at et krigslystent Taliban på alle kanter.
