Auf Kuba suchen Mac und Jack nach Murdoc, mit dem sie nach dem Attentat auf die Zentrale noch eine Rechnung offen haben. Doch die Suche bleibt zunächst erfolglos.

Phoenix erfährt, dass die osteuropäische Terrororganisation „Rote Faust“ einen grossen Anschlag plant und für dessen Finanzierung eine nicht unerhebliche Menge Diamanten geraubt hat, die nun im Tresorraum eines Casino-Hotels in Aserbaidschan lagern.

Ein Einsatz hoch in den Wolken über Südkorea geht schief, weil Riley es nicht fertigbringt, einen der Angreifer zu erschießen.

Mac reist nach Paris, um dort mehr über den Verbleib seines Vaters zu erfahren - ohne Jack, der ihn allerdings aufspürt und verärgert über den Alleingang ist.

Über dem Senegal verschwindet ein Flugzeug der CIA, das eine gefährliche Gefangene an Bord hatte. Phoenix soll herausfinden, was hoch über den Wolken passiert ist - nicht zuletzt, da es sich bei den Verschollenen um das Team von Commander Wheeler handelt, der der Sohn des Vizepräsidenten ist.

In Nigeria hat eine Rebellengruppe einen Ölbohrturm in die Luft gesprengt, um die Regierung zu erpressen. Ausserdem verhindern sie jeglichen Löschversuch.

Team Phoenix soll in Ecuador dafür sorgen, dass bei den anstehenden Präsidentschaftswahlen nicht Colonel Zarate an die Macht kommt, der den vorherigen Präsidenten gestürzt hat.

Das Team soll den Kunstschieber Enzo Lemaire schnappen, der seine Gewinne aus dem Schwarzhandel einer mutmaßlich terroristischen Vereinigung zukommen lässt.

Team Phoenix hat einen heiklen Auftrag: In den USA sollten 50 Kanister eines Nervengases vernichtet werden.

Jack hat Elwood gekidnappt, um ihm das Leben zu retten: Ein Gangster, mit dem er vor seinem Sinneswandel ein Ding gedreht hat, ist hinter ihm her und will das Geld, das Elwood ihm noch schuldet.

Es ist Weihnachten, und das Team freut sich auf einen besinnlichen Abend in Macs Haus. Doch daraus wird nichts: Mac wird verhaftet. Man legt ihm zur Last, den Hausmeister einer Lagerhalle mit einer Bombe getötet zu haben.

Cage hat Murdocs Attentat knapp überlebt, und das Team freut sich darauf, doch noch ein paar ruhige Stunden an den Feiertagen geniessen zu können.

Mac und das Team nehmen am Korman-Wettbewerb teil, bei dem alle US-Behörden den Prototypen eines modernen unbemannten Kampffahrzeugs präsentieren.

Matty ist wenig begeistert als sie erfährt, dass jemand Jacks alte Tarnidentität Duke Jacoby in New Orleans reaktiviert hat. Zusammen mit Mac und Jack reist sie in die Jazz-Metropole, um der Sache auf den Grund zu gehen.

Das Team vergnügt sich bei Mac zu Hause mit Scharade spielen, als plötzlich der Auftragskiller Henry Fletcher vor der Tür steht.

Das Team soll den serbischen Kriegsverbrecher Boris Mitrovic schnappen, der Interpol seit über 20 Jahren immer wieder entwischt. Um an ihn heranzukommen, müssen sich Mac & Co. an seinen Sohn Omar heften.

Das Team wird auf einen neuen Einsatz in die Ukraine geschickt: Der Informant Sergei Nelischuk, der den Kopf der hiesigen Mafia, Dmitry Pavlovich, der CIA ausliefern wollte, ist auf der Flucht.

Ein alter Bekannter von Jack und Matty ist plötzlich wieder auf der Bildfläche aufgetaucht: Emil Beck, ein ehemaliger Regierungsangestellter, der vor vielen Jahren Geheiminformationen stahl und danach untergetaucht ist.

Dawn sitzt völlig aufgelöst in Jacks Wohnung. Ihr Chef bei der CIA kam bei einem Autounfall ums Leben, sie vermutet allerdings Mord: Kurz vor seinem Tod hatte ihr Paul erzählt, dass jemand von der CIA offenbar falsche Pässe ausstellt, um Menschen illegal ins Land zu holen.

Es gibt eine neue Spur zu dem EMP, das Phoenix durch Rileys Versagen durch die Lappen gegangen ist: Es soll in Seoul den Besitzer wechseln.

Mac und das Team sind nach Puerto Rico gereist, um Macs altem Freund Carlos beim Wiederaufbau seines Hauses zu helfen, das Hurrikan Maria zum Opfer gefallen ist.

Mac und Riley werden in die Wüste Nevadas geschickt, um ein merkwürdiges Flugobjekt zu untersuchen, das plötzlich vom Himmel fiel. Der Wissenschaftler Dr. Herman soll sie unterstützen, ist zunächst allerdings wenig kooperativ.

Das Geheimnis um Macs Vater ist endlich gelüftet. Doch an Stelle einer ausschweifenden Versöhnung steht für die beiden MacGyvers eine Mission an: Walsh, der ehemalige Partner von MacGyver senior, hat eine leistungssteigernde Droge in die Finger bekommen und führt nichts Gutes im Schilde.