MacGyver

בפרק הפותח את העונה השנייה מחפשים מקגייוור והצוות, באמצעות טלפון סלולרי וכדורגל, לוחם של "אריות הים" שעל פי השמועות מוחזק בשבי במזרח התיכון.

באמצעות שרשרת ומשדר גלי מיקרו, מק והצוות מנסים למצוא את ריילי לאחר שהמשימה העצמאית הראשונה שלה עם קבוצה של האקרים מסוכנים יוצאת משליטה.

בעזרת חפתים וחוט תיל, מקגייוור והצוות מסתננים לקזינו יוקרתי כדי לשדוד יהלומים מכספת לפני שקבוצת טרוריסטים תעשה זאת ותמכור את התכשיטים תמורת נשק להשמדה המונית.

לאחר שמרדוק מסמם וחוטף את מקגייוור, מק נעזר במחט ובשיניו כדי לברוח ולהצטרף לצוות כדי להציל את קורבנו הבא של מרדוק.

חברי הצוות נאלצים לבטל את תוכניותיהם לליל כל הקדושים ועושים את דרכם למשולש ברמודה המפחיד כדי לחלץ את בנו של סגן הנשיא לאחר שמטוסו, ועליו אסירה מסתורית, מתרסק.

מק והצוות נעזרים בנגן קלטות ובדלי מפלסטיק בניסיון לכבות דליקה ענקית בבאר נפט בכפר ניגרי, שאותה הציתה קבוצת מורדים המנסה להפיל את השלטון על ידי הרס המשאב היקר ביותר של המדינה.

מקגייוור משתמש בתנור חימום וברוטב טבסקו כדי לעזור למועמד המוביל לנשיאות באקוודור לעבור השתלת לב קריטית, לאחר שקבוצת מורדים מנסה לטרפד את הגעת האיבר החיוני ליעדו.

מקגייוור וג'ק "גונבים" ציור יקר באמצעות מפת שולחן ושרוך נעליים במטרה למשוך סוחר ידוע לשמצה בפריטי אומנות גנובים לצאת ממחבואו, אולם צוותו של הסוחר משיג את הציור במרמה. אביה המנוכר של ריילי, אלווד (בילי בולדווין), מבקש שתאפשר לו להיות חלק מחייה, ומטי שולחת את בוזר למחנה אימונים למרגלים.

מק והצוות עוקבים אחר צוות של שכירי חרב אינדונזיים המובילים כמות קטלנית של גז עצבים גנוב, בתקווה שיובילו אותם אל מנהיגם המסוכן. ג'ק מתעמת עם אלווד (בילי בולדווין) בעניינה של ריילי, ובוזר נתון תחת לחץ עצום בבית הספר לריגול.

כאשר 32 סטודנטים נתקעים על ספינת מחקר באוקיינוס הקרח הצפוני ללא חימום ועם מספר מוקדי שריפות, מק מפתח קשר רגשי עם מנהיגת הקבוצה באמצעות שיחת וידאו ומדריך אותה כיצד לשרוד בעודם ממתינים לספינת החילוץ. ג'ק חוטף את אלווד כדי לגלות מה הוא זומם, ורגשותיו של בוזר כלפי ליאנה הולכים ומתחזקים.

משטרת לוס אנג'לס מתפרצת לחגיגות חג המולד של הצוות כדי לעצור את מק בחשד לפעילות טרור לאחר מציאת גופה בבניין שנהרס בהתפוצצות מטען נפץ שבנה מק.

מק וג'ק לכודים בביתו של מק שאותו מלכד יריבו המר של מק, "הרוח". מק נעזר במיקרופון קריוקי ובשנאי שמע כדי ליידע את הצוות שהפצצה הזו נועדה להסיח את הדעת מפצצה גדולה עוד יותר. באמצעות פלאשבקים אנו מתוודעים לפגישתם הווכחנית הראשונה של מק וג'ק.

בעוד מק משתתף בתחרות בין סוכנים ממשלתיים על בניית רכבי קרב רובוטיים, עליו לעזור למתחרה העיקרית שלו, אלי (אשלי טיסדייל), כשרכבה נפרץ ועושה דרכו לפנטגון. ג'ק משתתף בפגישת המחזור של התיכון שלו, בתקווה למפגש מכריע עם יריב ותיק שניצח אותו בקרב על תואר מלך השכבה.

הצוות יורד לניו אורלינס כדי לתפוס את הנוכלת (איימי סמארט) המתחזה לאשתו של "דיוק ג'קובי", אחד מכינוייו של ג'ק בסי-איי-איי, וכעת חייו של ג'ק נמצאים בסכנה כשיריביו הוותיקים של "דיוק" מחפשים נקמה.

לאחר שאחד מרוצחיו השכירים של מרדוק מסכים להסגיר את מרדוק לידיו של מקגייוור בתמורה לעשרה מיליון דולר, הצוות נאלץ להגן על מרדוק מפני המנטור שלו, ניקולס הלמן, הרוצה במותו. ג'ק מגלה שיש בו עדיין רגשות כלפי אימה של ריילי, דיאן (מייקל מישל).

מקגייוור, ליאנה, ריילי ובוזר מתחזים לזוגות בירח דבש בכפר נופש כדי להשיג מידע על פושע מלחמה סרבי מפי בנו, שזה עתה נישא. בוזר תוהה אם מטי יודעת על הקשר שלו עם ליאנה, וג'ק מגייס את אלווד (בילי בולדווין) לעזור לו לפרוץ לביתה של מטי.

מק, ג'ק וריילי יוצאים למצוא מאפיונר שהפך למודיע, אשר נחטף ונלקח לצ'רנוביל על ידי ראש מאפיה בין-לאומי החושש שימסור לסי-איי-איי מידע מפליל. בוזר מתאמץ לשמור על סוד מפניה של מטי.

מטי והצוות מחפשים איש מחשבים ממשלתי לשעבר שגנב מידע מסווג ונעלם, וחוברים שוב למשפחת ציידי הראשים, הקולטונים, המחפשים את האיש מסיבות אחרות.

מק והצוות חוקרים את מותו המסתורי של מנהלה הישיר של דון (איימי סמארט) בסי-איי-איי, והראיות מובילות לסוכן סי-איי-איי מושחת ולכנופיית זייפנים עצומה בגודלה.

מק וג'ק מנסים לחלץ את בנו של מיליארדר לאחר שנחטף על ידי לוחם לשעבר ב"אריות הים", המשתמש בנשק המבוסס על פעימה אלקטרומגנטית כדי לנתק את רשתות החשמל והתקשורת של גורד שחקים בשנחאי שבו מתגורר הילד.

בזמן שמק נמצא בפוארטו ריקו כדי לעזור לחברו שביתו נפגע בהוריקן, הוא נלקח כבן ערובה בבנק שמנהל חברו, כששודדים מנסים לגנוב שני מיליון דולר.

מק וריילי מותקפים על ידי קבוצת גברים עטויי מסכות לאחר שהממשלה מזמנת אותם לבחון חפץ מסתורי שהתרסק במדבר נבאדה.

בפרק החותם את העונה השנייה, מקגייוור זוכה להפתעה מרעישה כשהוא מנסה לומר למטי שהוא פורש מארגון "הפניקס".