Stargate Atlantis

Tim terselamatkan berkat kedatangan Kolonel Steven Caldwell, Daedalus, dan hancurnya dua kapal Wraith yang mendekat. McKay berharap Modul Titik Nol menjadi kunci keberhasilan mereka. Di sisi lain, Ford tak sadarkan diri setelah mengalami insiden.

Setelah tim kembali dari Bumi, kerusakan dan malafungsi aneh bermunculan. Sheppard mulai mencurigai banyak hal. Daedalus terjangkit Virus Wraith sehingga harus memasuki mode survival.

Pencarian Letnan Ford membawa Sheppard dan Teyla ke planet P3M-736, tempat mereka ditangkap oleh Ronon Dex yang tengah melarikan diri dari Wraith. Tim menawarkan bantuan kepada Ronon untuk menghadapi Wraith sekali lagi.

Saat berada di Planet Thenora, tim terkejut ketika McKay dan perwira marinir Laura Cadman dibawa ke Wraith Dart. Setelah tim menembak jatuh Dart, mereka mendapati kesalahan teknis yang membuat kesadaran Cadman berada di tubuh McKay.

Tim menemukan planet yang menjatuhkan hukuman kejam untuk pelaku kejahatan, yakni ditempatkan di dekat Stargate untuk ditawan oleh Wraith. Karena terlalu efektif, penduduk terpaksa menghukum orang-orang yang tidak bersalah demi menyenangkan Wraith.

Tim menemukan sisa-sisa eksperimen Ancient untuk menciptakan pembangkit listrik pamungkas dan McKay yakin bahwa ia bisa menyelesaikan eksperimen ini. Teyla dan Ronon menyadari bahwa Ronon bukanlah yang terakhir dari kaumnya.

Beckett memulai eksperimen pengobatan baru yang dapat mengubah Wraith menjadi manusia. Tim menemukan Wraith muda yang bisa menjadi subjek pertamanya. Karena dibesarkan oleh manusia, gadis ini sangat nekat dan antusias untuk mencoba apa pun.

Setelah disuntik dengan serum Wraith buatan Beckett, nyawa Sheppard terancam karena ia berangsur-angsur berubah menjadi hibrida serangga Iratus. Tim bergegas mencari solusi untuk memulihkan efek sampingnya, tapi semuanya tergantung pada Sheppard.

Sheppard (Joe Flanigan) dan tim menemukan kapal perang Ancient bernama Aurora yang sedang tidak beroperasi. Sheppard menaiki kapal itu secara virtual untuk menggali informasi dari Ancient.

Tim Stargate diculik oleh Letnan Aiden Ford yang membentuk tim tentara supernya sendiri, yakni orang-orang yang disuntik dengan enzim Wraith. Tim Ford berniat untuk menghancurkan Kapal Induk untuk membuktikan betapa kuatnya enzim tersebut.

Upaya menghancurkan Kapal Induk gagal dan tim disandera oleh Wraith. Lalu, Sheppard mendapati dirinya dibawa ke hadapan Ratu Wraith dan diinterogasi. McKay kembali ke Atlantis untuk meyakinkan penjaga agar membantu menyelamatkan tim.

Tim menemukan alat ciptaan Ancient yang tiba-tiba menarik Sheppard. Saat tim berusaha keras untuk membebaskannya dari tempat misterius itu, McKay menyadari bahwa di sana ada dilatasi waktu.

Tim berpacu dengan waktu untuk menggagalkan rencana Goa'uld yang ingin menghancurkan Atlantis. Mayjen Landry memperingatkan adanya bom yang akan diledakkan saat tim kembali ke Bumi. Sementara itu, dua kapal Wraith bergerak menuju Atlantis.

Saat menguji coba Puddle Jumper yang baru saja diperbaiki, McKay dan Kapten Hugh Griffin tiba-tiba kehilangan kendali dan kapal jatuh ke lautan. Tatkala Jumper mulai tenggelam perlahan-lahan, Griffin mengorbankan dirinya untuk menyelamatkan McKay.

Tim menemukan planet yang menyimpan teknologi ciptaan Ancient. Namun, keluarga kerajaan di planet ini tak mengizinkan orang lain untuk menggunakannya dan memandang rendah penduduk desa.

Tim menemukan dua Life Pod di ruang angkasa. Saat diselidiki lebih lanjut, tim memindahkan kesadaran dua orang itu ke Sheppard dan Dr. Weir secara tidak sengaja. Situasi memburuk ketika tim menyadari bahwa keduanya ingin saling menghabisi.

Tim Kolonel Sheppard diminta untuk bergerak ke M1K-177, lokasi diserangnya tim Mayor Lorne. Namun, begitu tiba, yang ada hanyalah bangunan yang terbakar dan sejumlah jasad yang diduga adalah Lorne dan timnya.

Letnan Kenmore terbangun di rumah sakit tanpa ingatan. Ia menduga ada yang tidak beres saat mimpi buruknya tentang menjadi Wraith tampak nyata. Ketakutannya tidak akan beralasan jika bukan karena serum yang mengubah Wraith menjadi manusia.

Sheppard dan timnya mengunjungi planet Taranis atas undangan dua warga terkemuka, Dr. Norina Pero dan Kanselir Lycus, yang meminta bantuan McKay untuk memperbaiki generator perisai di pangkalan Ancient serta kapal Ancient yang ditemukan.

Kenmore dan sekelompok Wraith tiba di Atlantis yang dilanda perang. Ingin memanfaatkan pengetahuannya untuk melawan Sheppard dan timnya, ia menyarankan sebuah pertukaran, serum Beckett, sebagai imbalan untuk menjaga Atlantis tetap tersembunyi.