Les Tortues Ninja doivent faire face aux attaques du clan dirigé par le redoutable Shredder. Celui-ci est en possession du gel radioactif qui a permis aux batraciens de muter. Avec l’aide d’une amie journaliste, les quatre héros à carapace vont redoubler d’efforts pour venir à bout du clan et empêcher Shredder de créer une nouvelle race de guerriers grâce au gel.
