Un jeune chirurgien autiste qui quitte Wyoming pour s'installer en Californie afin de compléter sa formation médicale compte sur ses hautes compétences afin de réfuter le scepticisme de ses collègues.

Lorsque des préjugés contre Shaun le force à se mettre sur le banc de touche à St. Bonaventure, ses collègues n'hésitent pas à s'attribuer le mérite de ses idées.

Tandis que Shaun et Claire improvisent afin de préserver un foie pour une greffe, Andrews se voit forcé de faire équipe avec Melendez pour s'occuper de la chirurgie de routine d'un patient aisé.

Melendez prend un risque afin de sauver une mère et son futur bébé, risquant des problèmes légaux à l'hôpital. Alors que Shaun a du mal à s'adapter a sa nouvelle vie, lui et Claire font équipe pour soigner une adolescente actrice de porno.

Apres s'être attaché à un jeune patient diagnostiqué d'un cancer fatal du cerveau, Shaun pense que celui-ci a reçu un mauvais diagnostique. La réaction allergique d'une personne âgée expose un problème de longue date avec son fils.

Lors de leur première nuit aux urgences, Shaun et ses collègues relèvent le défi de sauver un bus rempli d'invités d'un mariage.

Le Dr Shaun Murphy doit faire face aux préjugés d’une source improbable lorsqu’il aborde le cas d’un patient autiste, et le Dr Jared Kalu doit apprendre à accepter ses limites en tant que chirurgien.

Alors que Shaun est appelé à soigner une femme victime d'un tir lors d’un vol à main armée duquel il a lui-même été témoin, Claire a des ennuis lorsque son avis concernant le traitement réservé au tireur raciste diffère.

Shaun et Melendez font équipe afin de se diviser la chirurgie du cœur d'un enfant africain gravement malade. Une mère risque une opération inutile suite à l'oubli d'un échantillon de peau.

Alors que Shaun se bat parce qu'il pense que Melendez néglige le diagnostique d'un patient, Claire est victime de harcèlement sexuel par un docteur renommé.

Shaun accompagne Lea pour un voyage imprévu. Melendez et Claire tentent une greffe d'organe à risque sur des jumeaux siamois.

Alors que Shaun fait une annonce surprise après son retour de voyage avec Lea, une greffe d'organe entre jumeaux siamois présente des choix difficiles pour la mère et l'équipe chirurgicale.

Alors que Shaun soupçonne que les brûlures aux poumons d’un patient ont été causées par des produits chimiques utilisés pour fabriquer des bombes, Claire remet en question la raison pour laquelle une femme a refusé de consentir à la chirurgie qui sauvera sa vie.

Alors que Shaun et Jared discutent de la façon de traiter le cancer d’une fille transgenre âgée de 12 ans, Claire et une nouvelle résidente compétitive doivent travailler ensemble pour sauver un père célibataire d’un virus résistant aux médicaments.

Une opération visant à corriger une anomalie cardiaque chez un adolescent crée un désaccord entre Shaun et le Dr Morgan. L’expérience d’un nouveau résident en tant que policier le conduit à douter des motivations d’un tueur emprisonné à vouloir être un donneur d’organes.

Alors que les sentiments inattendus d’un homme paralysé des jambes amènent Melendez à penser qu’il peut à nouveau marcher, Andrews doit annuler une opération de chirurgie esthétique qui a mal tourné pour sauver la vie d’une femme.

Alors que Claire et Morgan ne s'entendent pas sur la façon de traiter un patient quil utilise une carte d'assurance volée, Shaun se lie d'amitié avec un patient adolescent qui se prépare pour une opération chirurgicale qui lui permettra de sourire pour la première fois.

Distrait par certaines nouvelles troublantes concernant Glassman, Shaun commet une erreur qui pourrait mettre fin à sa carrière.