Di awal Musim 3, Jack Ryan menyelidiki rencana rahasia untuk membangkitkan Uni Soviet lewat perang dan menuju misi berbahaya dengan bantuan Kepala Kantor Roma Elizabeth Wright dan Kepala Wilayah Rusia James Greer. Sementara, pembunuhan di Ceko memaksa pesidennya Alena Kovac berada dalam posisi berbahaya dengan Rusia.

Jack kabur setelah misinya di Yunani gagal. Ia harus menghindari pihak berwajib dari dalam dan luar negeri sebelum dibantu kawan lamanya.

Jack pergi ke Wina untuk melacak intel awalnya tentang Sokol. Greer menasehati Alena tentang perjanjian penting dengan NATO. Ayah Alena, Petr Kovac mengadakan perburuan di hutan Ceko.

Di Budapest, Jack dan Mike berencana mengelabui pedagang senjata untuk mengetahui letak nuklir Sokol. Greer menemukan informasi yang mungkin memberatkan Petr Kovac.

Jack dan Mike pergi ke bandara terbengkalai di Rusia untuk menghentikan senjata nuklor Sokol. Tapi tamu tak diundang merusak rencana mereka. Sementara, Petr berniat menyelamatkan Alena yang diculik kepala keamanannya sendiri.

Jack bergegas meghentikan senjata nuklir Sokol yang telah tiba di Republik Ceko. Sejarah rahasia Petr dan Luka terungkap dalam agenda balas dendam mematikan.

Di Moskow, Jack bekerjasama dengan Luka untuk mengungkap anggota fraksi tingkat tinggi yang diam-diam sedang melaksanakan rencana Sokol

Jack, Greer, Wright, Alena, dan Luka bekerjasama menghentikan dimulainya perang dunia ketiga.