मिलर, होल्डन और रोसिनांटे का दल एरॉस से बाल-बाल बचकर निकलने के बाद के हालातों का सामना करते हैं। हम मंगल की मरीन गोलंदाज़ी सार्जंट बॉबी ड्रेपर और उसकी पलटन से मुखातिब होते हैं और इसी समय पृथ्वी और मंगल के बीच “क्यूबाई मिसाइल संकट” और गहराने लगता है।

फ़्रेड जॉनसन और ओपीए के लड़ाकों की मदद से मिलर, होल्डन और रोसिनांटे का दल रहस्यमय प्रोटोमॉलीक्यूल के बारे में सुराग ढूँढते हुए एक खतरनाक कार्यवाही को अंजाम देते हैं। उधर पृथ्वी पर, एवसराला को फ़्रेड जॉनसन के बारे में एक अहम सच्चाई का पता चलता है।

टाइको स्टेशन पर लौटते हुए, होल्डन और मिलर के बीच छापे की कार्रवाई के तौर-तरीकों को लेकर गहरा मतभेद पैदा हो जाता है। इसी दौरान नैयोमी और एलेक्स इस घटना के प्रभाव से पैदा हुए तनाव का अलग-अलग तरीकों से सामना करते हैं। होल्डन और एमस एक भावनाशून्य हो चुके वैज्ञानिक से पूछताछ करते हैं। उधर एवसराला एक दुश्मन के पास ऐसे गठबंधन का एक प्रस्ताव भेजती है जो होना बेहद मुश्किल है।

मिलर एक खतरनाक और जोखिम भरी योजना बनाता है जिसके तहत वह मोर्मन के जहाज़ नैवू को हथियाना चाहता है ताकि एरॉस पर मौजूद बचे हुए प्रोटोमॉलीक्यूल को ख़त्म कर सके; कुछ अड़चनों के बाद होल्डन, रोसिनांटे का दल और फ़्रेड इसके लिए राज़ी हो जाते हैं। इसी बीच एवसराला को यह पता चल जाता है कि प्रोटोमॉलीक्यूल प्रोजेक्ट के पीछे आखिर कौन है।

जब रोसिनांटे पृथ्वी की तरफ़ तेज़ी से बढ़ रहे एक क्षुद्रग्रह का पीछा करता है तो यह समय के विरुद्ध दौड़ लगाने जैसा होता है। जहाँ पृथ्वी बुरे से बुरे अंजाम के लिए तैयारी कर रही होती है, वहीं एवसराला को यह जानकार आश्चर्य होता है कि होल्डन अभी भी ज़िंदा है और यह भी कि इस प्रलयंकारी हादसे को टालने के लिए रोसिनांटे ही कुछ कर सकता है।

क्षुद्रग्रह की टक्कर के बाद पृथ्वी और मंगल कुछ सवालों के जवाब खोजने में लग जाते हैं और एवसराला जूल्स-पिएर माओ के खिलाफ़ युद्ध की घोषणा कर देती है। रोसिनांटे का दल अब भी प्रोटोमॉलीक्यूल का अस्तित्व मिटाने की कोशिश में है। नैयोमी और होल्डन की सोच में फ़र्क होने से नैयोमी को कुछ फ़ैसले खुद लेने पड़ते हैं। बॉबी के साथ उसकी सैनिक टुकड़ी गैनमीड पर गश्त के लिए आती है और एक अकल्पनीय स्थिति का सामना करती है।

पृथ्वी और मंगल के बीच शांति वार्ता की तैयारियाँ एरिनराइट के लिए तनाव का कारण बन जाती हैं। बॉबी के बयान से गैनमीड पर हुए हमले के बाद एक गहरे राज़ से पर्दा उठता है। एंडरसन डॉस टाइको पर लगातार आ रहे शरणार्थियों के मुद्दे को अपने फ़ायदे के लिए इस्तेमाल करता है, साथ ही वह फ़्रेड जॉनसन और होल्डन के बीच के नाज़ुक गठबंधन को तोड़ने की धमकी भी देता है।

एक तरफ़ नैयोमी को सौरमंडल के अनपेक्षित हिस्सों में प्रोटोमॉलीक्यूल की मौजूदगी का संकेत मिलता है, वहीं ओपीए पर से फ़्रेड जॉनसन का नियंत्रण ख़त्म होने लगता है। इस नए खतरे से निपटने का कोई उपाय शायद उस सदमाग्रस्त शरणार्थी के पास हो सकता है जो गैनमीड से आया है।

प्रोटोमॉलीक्यूल और इसके पीछे काम कर रहे लोगों की खोज में युद्ध क्षेत्र में घुसने के लिए होल्डन अपनी कई नैतिक सीमाओं को पार कर जाता है। बॉबी पृथ्वी और मंगल के बीच चल रहे राजनैतिक संघर्ष में एक मोहरा बन जाती है, लेकिन यहाँ एवसराला को बातचीत करने वाले दोनों पक्षों में बैठे मानवता के दुश्मनों का पर्दाफाश करने का मौका दिखाई देता है।

होल्डन अपने दल के साथ गैनमीड के युद्ध से ध्वस्त और बर्बाद हो चुके स्टेशन पर पहुँचता है। एरिनराइट और एवसराला का एक-दूसरे से इस तरह सामना होता है कि उनका रिश्ता हमेशा के लिए बदल जाता है, और बॉबी पृथ्वी के एक ऐसे पहलू से मुखातिब होती है जिसके बाद दुश्मन के बारे में उसकी मूलभूत समझ में बदलाव आने लगता है।

रोसिनांटे के दल को एक ऐसे भयानक तथ्य के बारे में जानकारी मिलती है जिसमें कुछ ऐसा है जो उनकी समझ से परे है। बॉबी एक ऐसा निर्णय लेती है जो उसका भविष्य बदलकर रख देता है और उसके अतीत को भी नए सिरे से लिखता है, वहीं एवसराला अब तक हाथ न आने वाले जूल्स-पिएर माओ से संपर्क करने में अंततः कामयाब हो जाती है।

एक गुप्त लैब में हुए भयानक खुलासे के बाद नैयोमी और होल्डन एक दूसरे से अलग हो जाते हैं और रोसिनांटे के दल के बीच आपस में ही तनाव बढ़ जाता है। एवसराला और बॉबी मानवता के संतुलित भविष्य के लिए एक खतरनाक मुलाकात के लिए जाते हैं, जिसका नतीजा कुछ ऐसा होता है जिसकी कल्पना दोनों ही पक्षों ने नहीं की थी।

एक बहुत बड़े खतरे से रोसिनांटे के बाल-बाल बच निकलने से मिली राहत एक अप्रत्याशित दुश्मन की वजह से क्षणिक साबित होती है और जहाज़ को बचाने के लिए उसके दल को मजबूर होकर लड़ाई लड़नी पड़ती है। एवसराला दुश्मनों के चंगुल में फँस जाती है जहाँ उसे बचाने वाला कोई नहीं है और बचने के लिए अब बॉबी ड्रेपर ही उसकी एकमात्र उम्मीद है।