Antonia Scott er den mest intelligente kvinnen i verden - en god egenskap og en forbannelse på én og samme tid. Intellektet gjorde henne til den røde dronningen i et eksperimentelt prosjekt, men en personlig tragedie fjernet henne fra aktiv tjeneste. Nå må Jon Gutiérrez, en politimann i trøbbel, få henne med på laget igjen for å løse en sak som skal komme til å sette evnene hennes på prøve.

Ezequiel har myrdet Álvaro Trueba og kidnappet Carla Ortiz, de førstefødte barna til de mektigste familiene i Spania. Jon sier ja til å hjelpe Antonia. Selv om de kom feil ut av det først, er de nær å fakke Ezequiel etter en fartsfylt jakt som setter alles nerver i spenn. På cellen finner Carla ut at hun ikke er Ezequiels eneste fange.

Antonia og Jon har så vidt startet, men har allerede fått kidnappingseneheten, Ramón Ortiz, Laura Trueba og Mentor, skyggelederen i Rød dronning, imot seg. Alle lyver under etterforskningen. Antonia og Jon innser at det Ezequiel ber Ortiz og Trueba om, er at de faktisk innrømmer personlig skyld. Men Ezequiel ligger alltid ett steg foran, og nå er Antonia truet.

Antonia våkner opp alene vendt mot et veggmaleri. Hvorfor drepte ikke Ezequiel henne? Snikmorderen ville levere en beskjed. En beskjed som leder Antonia og Jon til en taxi og Ezequiels sanne identitet. Kidnappingsenheten har også funnet Ezequiels adresse og taxien, men Antonia legger merke til at brikkene ikke helt stemmer overens...

Antonia og Jon finner ut at Ezequiel samarbeider med datteren. Likevel henger ikke ting på greip. De har gjort for mange feil, men når kidnappingsenheten går i en felle, forstår Antonia og Jon at det ikke var feiltrinn. Carla får vite sannheten om kvinnen i den andre cellen. Jon tabber seg ut, så Mentor avslutter saken og fratar Antonia stillingen. Hun er ikke lenger den spanske røde dronningen.

Antonias far anklager henne for å ha kidnappet sin egen sønn og er i ferd med å få henne arrestert, men Jon hjelper henne å rømme. Antonia er alene, og byens politi er ute etter henne. Hun prøver å skjule seg frem til hun har en plan for å redde barnet sitt. Hun tar minnene, hjernen og gamle venner til hjelp... samt et kostyme. Antonia er i ferd med å ta på seg sitt livs viktigste oppdrag.

Jon og Antonia gjenforenes, men de har dårlig tid. Dronningen og væpneren må gå under bakken, i tunnelene som er fulle av feller og bomber. Sandra og Ezequiel venter på dem, og livene til Jorge og Carla står på spill. Antonia vet at dette ikke er over. Sandra er ikke den hun sier hun er. Hun er bare profeten til en som er mye mektigere, en som allerede har ødelagt det Antonia elsket mest.