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Jack Bauer è tornato. L'orologio inizia a scandire il tempo.

Tony e i suoi uomini mettono in atto un test per provare lefficacia del loro dispositivo. Il capo di Almeida, Emerson, ha in programma di consegnare il dispositivo a Juma, il quale intende servirsene per ricattare gli Stati Uniti. Jack sospetta lazione di una talpa allinterno dellFBI. Taylor si incontra con il Primo Ministro Matobo mentre Henry chiede aiuto al Samantha, la fidanzata di suo figlio.

Ormai il legame tra l'azione organizzata da Tony e la situazione in Sengala è conclamato, e la presidente Taylor si raccomanda con le massime autorità di competenza perché si faccia il possibile per ottenere informazioni necessarie a risolvere la crisi da Tony Almeida,. Questi però, durante l'interrogatorio, lancia a Jack un segnale molto significativo...

Jack è tornato, e anche Tony Almeida! La minaccia che incombe sulla nazione ha implicazioni globali.

Jack e Tony usano un metodo creativo per far uscire allo scoperto Matabo, ma il loro piano potrebbe essere messo in pericolo dallimprovviso arrivo di Walker. Moss e Gold ricevono la visita di un rappresentante dellUfficio del Procuratore Generale che sta indagando sullinterrogatorio di Tanner. Henry Taylor riceve nuove informazioni sulla morte del figlio.

Jack Bauer non si ferma davanti a nulla.

Dubaku dà l'avvio a un nuovo attacco a uno stabilimento chimico di Kidron, nell'Ohio, ma l'operazione viene fermata quando Jack e i suoi arrivan al suo nascondiglio. Nel frattempo Janis aiuta il direttore dello stabilimento a evitare che ci siano vittime prendendo manualmente il controllo delle valvole, e Ethan comincia a preoccuparsi seriamente per l'assenza del First Gentleman.

Jack e Bill riescono a ottenere un incontro con la presidente per chiedere le autorizzazioni necessarie per la loro caccia a Dubaku. Questi, intanto, procede al rapimento di Henry per utilizzarlo come ostaggio per ottenere il ritiro della truppe americane dal Sangala.

Jack e Renee riescono a rintracciare l'ignara fidanzata di Dubaku, la quale, una volta scoperti i piani del suo uomo, accetta di aiutarli a catturarlo prima che lasci il paese. Intanto Chloe O'Brian viene chiamata all'FBI, ma si trova ostacolata nel suo lavoro. La Presidente Taylor è sconvolta quando viene a sapere cosa è successo a suo marito.

Dubaku sta per lasciare gli Stati Uniti, ma la decisione di portare con sé la fidanzata non si rivela molto intelligente. Jack e Renee riescono quindi a rintracciarli. Nel frattempo le talpe all'interno dellFBI sono scoperte grazie all'abilità di Chloe.

Jack e Tony preparno un piano per interrogare Burnett nella Casa Bianca senza coinvolgere Bill, ma grazie a Janis Gold vengono scoperti e Jack viene fermato proprio mentre stava per ottenere da Burnett informazioni sull'imminente attentato.

Jack rimane risoluto nel voler rendere sicura la nazione. La crisi internazionale coplisce la casa del Presidente. La missione dell'orchestratore Jonas diventa chiara.

Lassedio alla Casa Bianca finisce in una vera e propria esplosione nella quale Bill Buchanan perde la vita. Jonas Hodges si preoccupa di coprire le sue tracce, quindi fa uccidere Ryan Burnett prima che spifferi tutto allFBI. La colpa ricade su Jack che lo stava interrogando...

Jack riesce a sfuggire all'FBI e segue una traccia sull'uomo che ha cercato di incastrarlo che lo conduce al senatore Mayer. Nel frattempo, però, Larry riesce a convincere Morris O'Brian ad aiutarlo in cambio dell'immunità per Chloe. Alla Casa Bianca, Ethan sospetta che Olivia abbia passato informazioni delicate a un reporter.

Jack recluta Tony affinche' si infiltri nella base di Starkwood in Virginia e recuperi le armi biologiche. La missione rischiera' però di venire compromessa per salvare la vita a un poliziotto della Port Authority. Nel frattempo Ethan Kanin rassegna le dimissioni...

Jack viene soccorso dall'Unità di Emergenza e trasportato all'FBI: non è contagioso, ma è stato infettato da un morbo creato in laboratorio, simile all'encefalite, della variante Creutzfeldt-Jakob il cui decorso fulmineo e' immancabilmente fatale. Intanto Tony, prigioniero di Starkwood, viene salvato da un collaboratore di Jonas Hodges...

Larry è costretto al ritiro dalla base di Starkwood, ma Tony rimane all'interno e cerca di rintracciare le armi con l'aiuto del capo del consiglio della compagnia. Intanto Jack comincia ad accusare i primi sintomi della malattia, e Olivia deve tenere a bada il suo amico reporter che vuole pubblicare l'intera storia rischiando di causare il panico nella popolazione.

Jonas Hodges riesce a constringere la presidente a sospendere l'attacco a Starkwood e a ottenere un incontro alla Casa Bianca. Ma all'FBI Jack capisce che cosa sta accadendo e convince Moss a preparare un intervento con l'aiuto essenziale di Tony.

Le condizioni di Jack peggiorano ma lui insesite a partecipare alle indagini per scoprire la talpa. Renée è gravemente colpita da un decesso, e Jonas Hodges riceve un ultimatum dai suoi capi.

La nazione è ancora vulnerabile agli attacchi terroristici, mentre la vita di Jonas Hodges è in bilico, e il suo capo rappresenta l'epicentro della minaccia crescente. Nel frattempo, Jack cerca di rendere pubblico il tradimento di Tony Almeida...

Jack cerca di aiutare l'FBI a scovare Tony e l'arma biologica di cui è in possesso, ma le sue condizioni continuano a peggiorare. Intanto Tony prende il fratello di un musulmano come ostaggio per costringere l'uomo a prendersi la responsabilità dell'imminente attacco...

Jack e l'FBI lottano contro il tempo per mettere le mani sul contenitore batteriologico prima che la sostanza che contiene venga liberata nella metropolitana. Intanto Olivia è nuovamente costretta a fare un patto che non le piace, e Kim si accorge di essere seguita da qualcuno.

Jack riesce a liberare Tony, e l'agente Walker prende il comando del team che come obiettivo quello di portare in salvo Kim Bauer. Nel frattempo, Aaron Pierce continua ad avere sospetti riguardo al coinvolgimento di Olivia Taylor nell'omicidio di Jonas Hodges...

Jack si preparara ad una fine che sembra ormai inevitabile, mente la presidente Taylor affronta l'ennesima scelta difficilissima.

It’s Inauguration Day in America and President Elect Allison Taylor is celebrating a new beginning with the rest of the country.