Sesongpremiere. Rundt tre måneder etter hendelsene i avslutningen av sesong 1, sendes U.S.S. Cerritos på et oppdrag som resulterer i et møte med "rar energi".

Våre nedre dekksfolk har trøbbel med å bli bedre kjent med fenrik Jet Manhaver, som har fått Boimlers køye og skift. I mellomtiden får vi et glimt av Boimlers liv på U.S.S. Titan, som er mer intenst enn han trodde det ville bli.

Etter å ha fått et spesialoppdrag av Dr. T’Ana, ber Tendi fenrik Mariner om hjelp. På U.S.S. Cerritos er Rutherford oppslukt av et mannskapsmysterium på broen.

U.S.S. Cerritos sendes til en planet for å undersøke en uforklarlig observasjon av en farlig Mugato.

Mariner og Boimler prøver å finne stedet for en legendarisk Stjerneflåte-fest, mens mannskapet på broen har med en usikker romvesendiplomat å gjøre.

Konsolideringsdagen for anomalier på U.S.S. Cerritos gir gjengen på nedre dekk blandede følelser. Kaptein Freeman prøver å forhandle om fred på pakledenes hjemplanet.

Mariner og Boimler er strandet på en ubeboelig planet med en sansende datamaskin. På Cerritos må kommandantløytnant Billups bevise sine ingeniørferdigheter for en gammel rival.

En konsulent ankommer U.S.S. Cerritos for å kjøre driller som krever at mannskapet på nedre dekk bytter oppgaver med mannskapet på broen.

Boimler prøver å finne seg en kompis på broen mens mannskapet på U.S.S. Cerritos har fri under en lang warp-tur.

I sesongfinalen av sesong 2 får U.S.S. Cerritos i oppdrag å bistå et Excelsior-klasse stjerneskip på et første kontakt-oppdrag.