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Com o Presidente Logan prestes a assinar um novo tratato armamentício com a Rússia, um assassino tem como alvo os únicos quatro que sabem que Jack Bauer está vivo, obrigando este último a voltar para Los Angeles.

Enquanto Chloe ajuda Jack a entrar no apartamento de Palmer para procurar provas, a UCT descobre que ele está vivo. Martha continua insistindo que Palmer tentou contatá-la a respeito de um assunto de segurança nacional.

A UCT prepara uma incursão no aeroporto, e os terroristas começam a matar reféns. Jack se vira para salvar Derek, escolhido como próximo a morrer. Martha procura uma transcrição do telefonema de Palmer.

Logan e Suvarov assinam o tratado enquanto Jack, preso pelos terroristas, tenta mandar um pedido de socorro à UCT.  Martha continua tentando chamar a atenção de Logan, sem sucesso.

A UCT é obrigada a investigar seu pessoal enquanto um encontro comovente entre Jack e Audrey acaba mal. Ao elevarem o nível de ameaça nacional, atores inesperados e segundas intenções vêm à tona, dando início ao desmonte do Presidente Logan.

Jack Bauer fica cara-a-cara com um vazamento interno, e detalhes perturbadores de uma ameaça terrorista são revelados. O Presidente Logan e o governo tentam lidar com a realidade de um terrível atentado aos EUA.

Jack Bauer é realinhado com o plano do presidente de mapear a ameaça terrorista e lidera a UCT em uma nova pista. Enquanto isso, a ameaça se intensifica e mais entra em jogo.

Agora que Jack Bauer expôs e interrogou o contato do governo com os terroristas, o presidente o readmite provisoriamente na UCT. Enquanto isso, a primeira-dama se opõe ao posicionamento que o marido e seus conselheiros planejam adotar. Jack e agentes da UCT tentam impedir que gás nervoso de grau militar dê cabo de vidas inocentes.

Apesar das tentativas por extremistas de impedir a assinatura do tratado armamentício entre os EUA e a Rússia, ela ocorreu, fazendo com que os EUA herdassem alguns dos inimigos da Rússia. O mentor terrorista e bilionário Vladimir Bierko intimida o governo americano enquanto Lynn McGill, líder autocrático da UTC, é duramente criticado pelo Presidente Logan.

O inimigo intensifica a ameaça, e a primeira-dama toma as rédeas. Enquanto isso, extremistas russos planejam um ato de guerra que pode mudar o mundo.

Martha trava uma luta interna ao perceber que Logan não tentou salvá-la. Jack vai à casa de Christopher Henderson procurar provas enquanto a UCT corre para evitar um atentado a gás nervoso em um grande hospital.

Quando Jack reencontra Kim e questiona Henderson, o vice-presidente apela para a lei marcial. Lynn fica sabendo do assassinato da irmã, e Ostroff dispara um cilindro de gás Sentox na UCT.

Quando os agentes da Segurança Nacional Karen Hayes e Miles Papazian chegam à UCT para tratar de uma situação preocupante, eles encontram resistência. Enquanto a UCT enfrenta suas próprias dificuldades de liderança, o governo deve lidar com a recente chegada do Vice-Presidente Hal Gardner.

Com a ajuda da agência internacional de inteligência Interpol, a UCT segue novas pistas que levam a Bierko, enquanto a teórica da conspiração e primeira-dama Martha Logan questiona a próxima estratégia de defesa do governo. Os agentes da Segurança Nacional Miles Papazian e Karen Hayes chegam à UCT e tentam mudar o protocolo envolvendo os agentes.

Quando Jack Bauer interroga o elo mais recente ao gênio terrorista Bierko, segredos surpreendentes são revelados. Nesse meio tempo, o conflito entre a UCT e agentes da Segurança Nacional se intensifica, enquanto terroristas ameaçam ampliar o atentado.

Jack enfatiza a importância de deter o conspirador e terrorista  Christopher Henderson, enquanto o vice-presidente e o governo tentam um realinhamento com a UCT. Nesse meio tempo, uma empoderada Audrey é obrigada a tomar uma decisão importante, enquanto Wayne Palmer e o Agente Pierce se unem.

Novas descobertas relacionadas aos horrores ocorridos no dia mantêm Jack Bauer longe da UCT. Nesse meio tempo, Chloe e Audrey se unem para ajudar nas operações de campo, e a investigação dá uma guinada.

Embora o Presidente Logan alegue que o país não esteja mais sob ataque, a lei marcial ainda vigora, e a UCT segue sob pressão para encontrar o restante dos fugitivos.  Enquanto isso, Jack, Audrey e o Secretário da Defesa James Heller se encontram para uma reunião importante.

O intenso interrogatório do Agente Jack Bauer revela provas incriminadoras, mas suas táticas têm graves consequências. Enquanto isso, o Presidente Logan tem mais problemas.

Chefões da Segurança Nacional Karen Hayes e Miles Papazian reagem a novos acontecimentos, enquanto o ex-comandante da UCT Bill Buchanan colabora com a analista Chloe O'Brian para ajudar Jack Bauer. No meio da noite, as emoções no retiro presidencial alcançam novos patamares para a primeira-dama.

Enquanto Jack Bauer chega perto de levar os culpados à justiça, o Presidente Logan toma medidas impensáveis para impedir o progresso de Jack. Com os comandantes da UCT Bill Buchanan e Karen Hayes atuando juntos e em segredo, cria-se uma dinâmica contraproducente. Enquanto isso, Vladimir Bierko reaparece.

O Agente Bauer se mostra o incansável patriota na busca por provas que incriminem o Presidente Logan. Nesse meio tempo, a volta de Vladimir Bierko reacende a possibilidade de uma nova e devastadora ameaça.

Jack e Henderson atacam um submarino, enquanto Bierko se prepara para atacar Los Angeles. Chloe traz alguém do seu passado para ajudar. Martha e Aaron alistam Mike para ajudar no plano de expor Logan.

Jack decide enfrentar o presidente na tentativa de obter uma confissão que prove seu envolvimento nos acontecimentos do dia. Martha mostra o ódio pelo marido na frente da imprensa, enquanto Logan homenageia o falecido Palmer. Jack e Audrey vivem um momento de ternura quando a crise parece ter arrefecido, mas Jack percebe que seus problemas só começaram com o passado vindo à tona.