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La muerte de un joven a causa de un neumovirus altamente contagioso pone en alerta al Centro Nacional de Salud y a la UAT. Su propagación puede acabar con la vida de un millón de personas en una semana. Por eso, Jack Bauer y su nuevo hombre de confianza y novio de su hija Kim -que actualmente también trabaja en la UAT-, Chase Edmunds, se ponen manos a la obra

El Servicio Nacional de Salud informa a la UAT de que el virus puede transportarse en forma cristalizada y adoptar un aspecto muy similar al que la cocaína. Poco después, Jack y Chase acuden a la casa donde vivía el "camello" muerto por el virus y allí descubren que un joven llamado Kyle Singer hará una entrega esa misma tarde.

El virus es liberado al romperse la bolsa que lo contiene.

Tras escapar con Kyle Singer la única oportunidad de controlar el virus, Jack Bauer llama al presidente Palmer. A la vista de que el presidente no negocia con terroristas, le propone una solución desesperada. El propio Bauer liberará a Salazar y lo entregará a su hermano, evitando que el virus sea liberado a la población sin comprometer la política del presidente en materia terrorista

El motín que provoca Jack Bauer sacar de la cárcel a Ramon Salazar se descontrola, y acaban como rehenes de los presos. Kyle Singer, retenido por los hombres de Salazar, es encontrado por la UAT, pero esta información no llega a tiempo a Jack Bauer que huye con Salazar sin saber que la amenaza del virus está controlada

Tras la huida de Jack con Ramon Salazar la obsesión de la UAT es comunicar a Jack que el portador del virus ha sido localizado y capturado. Si no es posible tal comunicación el helicóptero será derribado. Ryan Chapelle (jefe de la división) se hace cargo de la UAT mientras Tony sigue hospitalizado, y reclama al presidente Palmer para confirmar la acción de derribar el helicóptero en el que escapa.

Gael encierra a Kim en la sala de archivos al verse descubierto

Tony llama a Palmer para mostrarle un vídeo en el que Jack explica que la amenaza del virus era una mentira

Los hombres de Salazar empiezan a torturar a Chase para sacarle información. Poco después, entrará una nueva aspirante a hacerse con el virus, y que terminará haciéndose con él: Nina Myers, la mujer que mató a la esposa de Jack. Chapelle monta en cólera por no pocer localizar a Jack, y Tony hace lo posible para arreglar la situación, aunque no confían en él porque está convaleciente de la herida

Jack se va a encontrar de nuevo, cara a cara, con Nina Myers, mientras que la situación de Chase, torturado por el clan Salazar, es cada vez más complicada. Palmer, cada vez más presionado, decide contar con su ex mujer, Sherry, para que le eche una mano.

La situación se complica cada vez más, con Jack, Nina y los Salazar en máxima tensión, al igual que Palmer, que le explica a Sherry qué quiere de ella para afrontar la situación.

La UAT está lista para intervenir y hacerse con el virus, mientras que Nina sigue insistiéndole a Ramón con que Jack es de la UAT, pero no se lo cree. Sherry sigue su plan para ayudar a su marido, mientras que, en la UAT, Alan le dice a Kim que es imposible que el bebé sea de Cloe. Todo se prepara para la entrega de virus, en México...

Amador es la clave, ya que continúa con el virus en su poder. La tarea de localizarle se va a complicar aún más cuando un virus informártico entre en la red de la UAT e impida la conexión entre agencias. Por su parte, tanto Palmer como Cloe, cada uno por causas diferentes, tendrán que enfrentarse a situaciones comprometedoras.

Palmer reúne a todos los dispositivos de emergencia, ya que Amador está en Los Ángeles con suficiente virus para afectar a toda la ciudad. Poco después, el presidente tendrá que mentir para asegurar su posición. En la UAT, Nina huirá dejando varios muertos a sus espaldas...

Chapelle quiere apartar a Jack del caso por haber matado a un testigo fundamental, mientras que en la UAT estrechan el cerco a Alvers. Sherry sigue con probemas por su intento de ayuda a su ex marido, el presidente Palmer.

Jack y Chase, de nuevo juntos, piensan que Amador les llevará, por fin, al hombre que tiene el virus en su poder. Palmer vuelve a llevarse una decepción con Sherry..

Saunders obliga a Palmer a mantener una rueda de prensa y luego ordena la muerte de un agente que puede localizarle. Jack sigue a una mujer que le lleva hasta Saunders, pero se encontrará con alguna sorpresa por el camino. Por otro lado, así como los síntomas de Gael empeoran, Michelle descubre la forma de paliar el sufrimiento de las víctimas del hotel.

Jack y Chase corren a contrarreloj para capturar a Saunders antes de que muera, mientras Chappelle planea escapar. Por otro lado, Michelle investiga desesperadamente y se da cuenta de que un cliente infectado del hotel puede que haya dormido sobre sus manos.

Jack trabaja con Kim sobre un trabajo secreto que puede ayudarles a localizar a Saunders. Palmer informa a su gabinete de la crisis, mientras Saunders hace otra demanda. La persecución detecta al hombre que abandonó el hotel y se da cuenta que el virus se extiende entre la gente

Jack intenta utilizar a la hija de Saunders como palanca para ganar ventaja y controlar el virus. Michelle consigue los resultados de su prueba, mientras Adán ve que el virus se está expandiendo cerca de su casa. Tony se encuentra comprometido cuando Saunders explota su única debilidad

Tony trabaja para liberar a Jane antes de que Saunders pueda dañar a Michelle, pero Chloe y Jack se vuelven sospechosos por sus actividades. Sherry encuentra al rival político de Palmer y le chantajea con un trato.

Jack tiene un conflicto con Tony, ya que el tiempo para cambiar de rehén se acerca. Keeler encuentra a Palmer y le exige su dimisión, mientras Wayne empieza una operación secreta contra Sherry.

Jack abre el sobre para forzar a Saunders a revelar el lugar de los frascos que faltan. Sherry queda con David para hablar de sus condiciones, mientras Wayne irrumpe en su para encontrar pruebas incriminatorias. Tony se enfrenta a una dura pena por sus esfuerzos por salvar a Michelle

Jack abre el sobre para forzar a Saunders a revelar el lugar de los frascos que faltan. Sherry queda con David para hablar de sus condiciones, mientras Wayne irrumpe en su para encontrar pruebas incriminatorias. Tony se enfrenta a una dura pena por sus esfuerzos por salvar a Michelle